More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3624 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
479 aa  930    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.09 
 
 
511 aa  365  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.07 
 
 
487 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  43.25 
 
 
484 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.58 
 
 
484 aa  361  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.16 
 
 
484 aa  361  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.4 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.59 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  43.37 
 
 
476 aa  353  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  39.53 
 
 
482 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  39.11 
 
 
482 aa  349  6e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  43.97 
 
 
478 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  43.54 
 
 
480 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.6 
 
 
483 aa  340  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  45.45 
 
 
479 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  45.14 
 
 
478 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.18 
 
 
477 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.6 
 
 
482 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.76 
 
 
479 aa  333  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.76 
 
 
479 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  42.83 
 
 
479 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.29 
 
 
479 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.29 
 
 
482 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.34 
 
 
477 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.91 
 
 
483 aa  330  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.03 
 
 
476 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  42.31 
 
 
478 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  45.48 
 
 
478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  45.48 
 
 
478 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  44.94 
 
 
481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  42.34 
 
 
478 aa  326  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  44.13 
 
 
475 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  45.69 
 
 
478 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.72 
 
 
481 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  44.15 
 
 
479 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  42.47 
 
 
478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  39.28 
 
 
480 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  47.48 
 
 
487 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  39.5 
 
 
494 aa  319  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.64 
 
 
481 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  38.35 
 
 
478 aa  319  6e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  43.64 
 
 
481 aa  319  6e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  44.02 
 
 
481 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.9 
 
 
476 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  43.34 
 
 
481 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0971  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.86 
 
 
511 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.46 
 
 
482 aa  316  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.1 
 
 
489 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  40.29 
 
 
483 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  41.07 
 
 
517 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1415  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  41.65 
 
 
521 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  41.07 
 
 
517 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1863  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.89 
 
 
513 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  40.49 
 
 
514 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0854  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.44 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  38.21 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  37.82 
 
 
489 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  41.59 
 
 
485 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.08 
 
 
476 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.15 
 
 
488 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.27 
 
 
475 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.14 
 
 
511 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  39.11 
 
 
490 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.96 
 
 
518 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.72 
 
 
478 aa  300  4e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  41.12 
 
 
485 aa  299  8e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.42 
 
 
505 aa  299  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  41 
 
 
479 aa  299  9e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04321  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  42.56 
 
 
523 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.19 
 
 
498 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  42.69 
 
 
476 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  40.87 
 
 
480 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  40.38 
 
 
489 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  40.38 
 
 
488 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  39.49 
 
 
487 aa  296  5e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
485 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  40.14 
 
 
488 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
490 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
490 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
490 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
490 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
485 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
485 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.79 
 
 
492 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
485 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  40.87 
 
 
479 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
482 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  39.71 
 
 
488 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.82 
 
 
511 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  39.67 
 
 
488 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  39.67 
 
 
488 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  38.64 
 
 
490 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1767  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  41.06 
 
 
520 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.506609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  40.69 
 
 
478 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.84 
 
 
480 aa  295  2e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1766  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  42.07 
 
 
523 aa  294  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0127704  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.13 
 
 
511 aa  293  4e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00934682  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  43.41 
 
 
483 aa  293  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1476  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  43.8 
 
 
525 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.217094  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.91 
 
 
489 aa  292  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>