More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4620 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
476 aa  929    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  66.88 
 
 
478 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  65.34 
 
 
475 aa  611  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  63.92 
 
 
478 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  62.66 
 
 
478 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  63.92 
 
 
478 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  61.6 
 
 
478 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  62.21 
 
 
479 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  63.81 
 
 
483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  63.11 
 
 
480 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  61.43 
 
 
477 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  63.18 
 
 
477 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  62.39 
 
 
482 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  61.76 
 
 
482 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  62.61 
 
 
479 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  61.01 
 
 
478 aa  554  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  61.01 
 
 
478 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.54 
 
 
479 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.75 
 
 
479 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  61.22 
 
 
478 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.75 
 
 
479 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  63.33 
 
 
481 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  62.9 
 
 
481 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.24 
 
 
481 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  62.37 
 
 
479 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  53 
 
 
487 aa  489  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  56.49 
 
 
479 aa  461  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  54.22 
 
 
487 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  61.66 
 
 
483 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  53.2 
 
 
478 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  54.19 
 
 
478 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  56.47 
 
 
481 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  54.19 
 
 
478 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  53.55 
 
 
478 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.79 
 
 
478 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  53.99 
 
 
476 aa  422  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  54.67 
 
 
499 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  53.38 
 
 
487 aa  408  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.01 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.64 
 
 
475 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.01 
 
 
483 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2819  NADH dehydrogenase subunit N  50.77 
 
 
483 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.89 
 
 
487 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.17 
 
 
487 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.86 
 
 
484 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.29 
 
 
484 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.52 
 
 
484 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  42.47 
 
 
484 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  42.41 
 
 
482 aa  346  5e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  41.77 
 
 
482 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  41.28 
 
 
478 aa  341  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  42.92 
 
 
489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.37 
 
 
479 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  45.28 
 
 
481 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.28 
 
 
481 aa  333  5e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.38 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0969  NADH dehydrogenase I, N subunit, putative  43.19 
 
 
454 aa  327  3e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.314419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  43.08 
 
 
485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.15 
 
 
482 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  42.06 
 
 
494 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  42.86 
 
 
485 aa  325  1e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  38.7 
 
 
490 aa  322  8e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  42.17 
 
 
493 aa  320  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  41.33 
 
 
488 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  38.88 
 
 
489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  41.33 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  41.33 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  38.7 
 
 
490 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  43.7 
 
 
483 aa  319  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  42.39 
 
 
494 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  40.13 
 
 
480 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  41.57 
 
 
488 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  41.33 
 
 
488 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.07 
 
 
476 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  38.75 
 
 
492 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  41.3 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  39.45 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  39.45 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  39.45 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  39.45 
 
 
490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  41.65 
 
 
491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  41.3 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  41.3 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  41.3 
 
 
485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  40.55 
 
 
480 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.47 
 
 
488 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  40.17 
 
 
479 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.93 
 
 
511 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  41.37 
 
 
497 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  41.38 
 
 
500 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.35 
 
 
489 aa  303  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  41.56 
 
 
495 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0556  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.99 
 
 
469 aa  301  2e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  41.39 
 
 
481 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.46 
 
 
491 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  41.51 
 
 
491 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.7 
 
 
517 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.55 
 
 
476 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  41.28 
 
 
478 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  37.7 
 
 
517 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>