More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1568 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
487 aa  945    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  59.75 
 
 
483 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  54.22 
 
 
476 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  57.63 
 
 
478 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.34 
 
 
477 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  56.99 
 
 
478 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.13 
 
 
477 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  58.41 
 
 
480 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  56.09 
 
 
478 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  55.91 
 
 
478 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.44 
 
 
482 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  57.66 
 
 
479 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  54.87 
 
 
479 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.57 
 
 
479 aa  491  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.57 
 
 
479 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  56.57 
 
 
479 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.7 
 
 
482 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  57.3 
 
 
481 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  57.52 
 
 
481 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  57.11 
 
 
475 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  56.24 
 
 
478 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  56.24 
 
 
478 aa  471  1e-132  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.16 
 
 
481 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  55.25 
 
 
478 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  59.11 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  56.66 
 
 
478 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  53.38 
 
 
479 aa  457  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.26 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  53.9 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.13 
 
 
475 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  53.09 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  53.46 
 
 
478 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  53.46 
 
 
478 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  52.71 
 
 
487 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  54.06 
 
 
478 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.57 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  54.04 
 
 
499 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  50.21 
 
 
487 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  45.58 
 
 
484 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  51.4 
 
 
476 aa  395  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.15 
 
 
483 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  53.23 
 
 
481 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.07 
 
 
487 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.7 
 
 
487 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.25 
 
 
484 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.86 
 
 
484 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.96 
 
 
484 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2819  NADH dehydrogenase subunit N  49.44 
 
 
483 aa  355  8.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.68 
 
 
479 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  41.77 
 
 
494 aa  330  4e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  42.77 
 
 
485 aa  329  7e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  42.77 
 
 
485 aa  328  9e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.09 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.64 
 
 
476 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  40.88 
 
 
478 aa  322  7e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  40.9 
 
 
489 aa  322  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  40 
 
 
517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  39.73 
 
 
517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.4 
 
 
476 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  39.66 
 
 
482 aa  318  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  39.66 
 
 
482 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.59 
 
 
488 aa  317  4e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0474  proton-translocating NADH-quinoneoxidoreductase, chain N  38.48 
 
 
474 aa  316  8e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0969  NADH dehydrogenase I, N subunit, putative  40.2 
 
 
454 aa  312  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.314419  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0556  NADH dehydrogenase I, N subunit  35.24 
 
 
469 aa  312  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  44.06 
 
 
483 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.13 
 
 
505 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  40.98 
 
 
488 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
488 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  44.55 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1296  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.53 
 
 
511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  41.23 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.55 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  39.4 
 
 
490 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  41.13 
 
 
488 aa  302  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  40.89 
 
 
489 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  41.75 
 
 
492 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.96 
 
 
476 aa  301  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  39.65 
 
 
490 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  39.08 
 
 
480 aa  300  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.62 
 
 
491 aa  299  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  41.56 
 
 
481 aa  299  7e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  40.44 
 
 
491 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  41.03 
 
 
480 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  41.46 
 
 
487 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2025  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  38.53 
 
 
514 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.47 
 
 
489 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  40.79 
 
 
479 aa  296  4e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1597  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.63 
 
 
511 aa  295  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  42.07 
 
 
491 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.47 
 
 
482 aa  292  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>