More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2819 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2819  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
483 aa  936    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  50.77 
 
 
476 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  49.26 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  48.34 
 
 
478 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  48.74 
 
 
479 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.53 
 
 
477 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  46.79 
 
 
478 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.79 
 
 
477 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.31 
 
 
479 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.31 
 
 
479 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.4 
 
 
483 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.42 
 
 
482 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  47.37 
 
 
478 aa  386  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  49.55 
 
 
478 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.67 
 
 
479 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  46.47 
 
 
480 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  47.93 
 
 
478 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  49.66 
 
 
475 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  48.65 
 
 
479 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  47.05 
 
 
482 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.73 
 
 
481 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  49.66 
 
 
479 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  48.67 
 
 
481 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  48.67 
 
 
481 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  44.77 
 
 
479 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  47.7 
 
 
476 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  47.95 
 
 
481 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  49.34 
 
 
478 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  49.08 
 
 
478 aa  361  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.38 
 
 
480 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.13 
 
 
478 aa  360  4e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  49.39 
 
 
487 aa  356  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  46.97 
 
 
478 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  48.17 
 
 
478 aa  352  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  45.39 
 
 
483 aa  347  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  46.5 
 
 
478 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  46.5 
 
 
478 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  47.02 
 
 
487 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  48.05 
 
 
499 aa  339  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  45.21 
 
 
487 aa  335  9e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.92 
 
 
483 aa  330  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.51 
 
 
487 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.55 
 
 
475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.58 
 
 
487 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.28 
 
 
484 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.28 
 
 
484 aa  300  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  40.21 
 
 
485 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  38.04 
 
 
484 aa  290  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
485 aa  289  9e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.37 
 
 
484 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  37.99 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  38.81 
 
 
482 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  38.36 
 
 
482 aa  280  5e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.18 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  41.18 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  40.37 
 
 
483 aa  274  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0969  NADH dehydrogenase I, N subunit, putative  36.3 
 
 
454 aa  271  1e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.314419  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.92 
 
 
479 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  39.68 
 
 
489 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.84 
 
 
476 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  39.46 
 
 
486 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.65 
 
 
482 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  38.13 
 
 
490 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  38.02 
 
 
490 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  41 
 
 
487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  38.72 
 
 
480 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.78 
 
 
488 aa  264  2e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  37.47 
 
 
480 aa  262  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  37.7 
 
 
479 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  38.19 
 
 
494 aa  262  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
493 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  38.72 
 
 
492 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.37 
 
 
476 aa  259  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0556  NADH dehydrogenase I, N subunit  32.56 
 
 
469 aa  258  1e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  38.54 
 
 
491 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  38.13 
 
 
489 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.75 
 
 
476 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  38.08 
 
 
485 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.4 
 
 
482 aa  256  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.13 
 
 
481 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  38.36 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  38.36 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  38.24 
 
 
488 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
490 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  38.24 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  38.24 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  38.94 
 
 
497 aa  253  7e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.17 
 
 
489 aa  252  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0474  proton-translocating NADH-quinoneoxidoreductase, chain N  34.55 
 
 
474 aa  251  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  37.29 
 
 
481 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  38.61 
 
 
497 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  38.6 
 
 
495 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3541  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.89 
 
 
517 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2573  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2  34.67 
 
 
517 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>