More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0721 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  68.12 
 
 
480 aa  645    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
482 aa  950    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  54.45 
 
 
482 aa  529  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  59.21 
 
 
483 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  60.17 
 
 
478 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  54.66 
 
 
482 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  56.62 
 
 
494 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  57.71 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.29 
 
 
488 aa  501  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  58.05 
 
 
481 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  58.05 
 
 
481 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  52.39 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  55.02 
 
 
482 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  51.53 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.3 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
490 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  49.59 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  53.29 
 
 
493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
490 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.72 
 
 
484 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
489 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
485 aa  445  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  55.35 
 
 
491 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
485 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
485 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
485 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  52.9 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  49.37 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  49.37 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  49.58 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  52.67 
 
 
488 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  49.37 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  51.07 
 
 
491 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  50.1 
 
 
494 aa  438  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  49.68 
 
 
491 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  47.02 
 
 
479 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  47.02 
 
 
480 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  50.22 
 
 
500 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1437  NADH dehydrogenase subunit N  49.06 
 
 
500 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  49.19 
 
 
497 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  51.24 
 
 
495 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  52.28 
 
 
495 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  51.2 
 
 
497 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2049  NADH dehydrogenase subunit N  52.67 
 
 
490 aa  412  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.141161  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  49.36 
 
 
485 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0970  NADH dehydrogenase subunit N  49.9 
 
 
497 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  50.67 
 
 
497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  49.14 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2201  NADH dehydrogenase subunit N  51.84 
 
 
491 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487391  normal  0.368629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1878  NADH dehydrogenase subunit N  51.62 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  48.78 
 
 
487 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0885  NADH dehydrogenase subunit N  51.57 
 
 
497 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0834  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.76 
 
 
499 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.748018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.97 
 
 
499 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  46.99 
 
 
486 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.2 
 
 
483 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.22 
 
 
483 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.19 
 
 
477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  43.76 
 
 
478 aa  356  5e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  41.6 
 
 
478 aa  355  1e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.28 
 
 
477 aa  350  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.06 
 
 
481 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.44 
 
 
482 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  42.06 
 
 
480 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.8 
 
 
482 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  40.93 
 
 
476 aa  339  8e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  42.95 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  40.46 
 
 
479 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  40.66 
 
 
478 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  41.39 
 
 
478 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.21 
 
 
487 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.28 
 
 
487 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  43.21 
 
 
479 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  40.94 
 
 
475 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  40.5 
 
 
484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.66 
 
 
479 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.27 
 
 
484 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.41 
 
 
479 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.41 
 
 
479 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  45.81 
 
 
476 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.16 
 
 
484 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  40.68 
 
 
479 aa  322  7e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.37 
 
 
484 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  42.71 
 
 
478 aa  319  5e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  42.71 
 
 
478 aa  319  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  43.25 
 
 
479 aa  315  8e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  42.39 
 
 
478 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.97 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
481 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  42.08 
 
 
481 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  42.86 
 
 
487 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.74 
 
 
491 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.71 
 
 
476 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  42.65 
 
 
478 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0875  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36 
 
 
489 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000367374  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.77 
 
 
478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  43.95 
 
 
478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>