More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1416 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
494 aa  973    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  75.51 
 
 
493 aa  715    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  67.2 
 
 
497 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  65.66 
 
 
495 aa  624  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  68.01 
 
 
497 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  68.08 
 
 
495 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0970  NADH dehydrogenase subunit N  67 
 
 
497 aa  618  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  65.38 
 
 
500 aa  615  1e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  68.01 
 
 
497 aa  609  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1437  NADH dehydrogenase subunit N  63.34 
 
 
500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0885  NADH dehydrogenase subunit N  67.81 
 
 
497 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  57.32 
 
 
494 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  54.16 
 
 
490 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  54.16 
 
 
490 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  54.66 
 
 
492 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  57.66 
 
 
491 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  60.41 
 
 
491 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  53.32 
 
 
488 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  52.99 
 
 
491 aa  495  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  55.44 
 
 
485 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  53.53 
 
 
488 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  53.53 
 
 
488 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  53.53 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
485 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
490 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
485 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  53.32 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  54.81 
 
 
485 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  53.32 
 
 
488 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2049  NADH dehydrogenase subunit N  58.18 
 
 
490 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.141161  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  53.32 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  55.8 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2201  NADH dehydrogenase subunit N  55.91 
 
 
491 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487391  normal  0.368629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1878  NADH dehydrogenase subunit N  55.51 
 
 
491 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  55.65 
 
 
483 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.77 
 
 
482 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  50.82 
 
 
481 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  50.1 
 
 
480 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.82 
 
 
481 aa  427  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  47.73 
 
 
482 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  47.31 
 
 
482 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.97 
 
 
499 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  46.65 
 
 
478 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0834  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.78 
 
 
499 aa  413  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.748018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.62 
 
 
482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.52 
 
 
488 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  51.37 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  42.26 
 
 
480 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  42.05 
 
 
479 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  45.28 
 
 
485 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  45.49 
 
 
485 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.59 
 
 
481 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.56 
 
 
484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  46.14 
 
 
487 aa  353  5e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  42.06 
 
 
476 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  44.58 
 
 
478 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  44.58 
 
 
478 aa  335  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  46.33 
 
 
486 aa  331  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.76 
 
 
483 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  43.4 
 
 
478 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  41 
 
 
479 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  39.96 
 
 
478 aa  324  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  43.97 
 
 
475 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  41.92 
 
 
480 aa  323  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  43.47 
 
 
479 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  39.75 
 
 
478 aa  319  6e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.03 
 
 
483 aa  317  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.02 
 
 
477 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.84 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  41.35 
 
 
479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.75 
 
 
482 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  39.34 
 
 
478 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  41.04 
 
 
478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  40.94 
 
 
481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  40.51 
 
 
481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.36 
 
 
481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  40.46 
 
 
478 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.41 
 
 
479 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.08 
 
 
479 aa  299  7e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.08 
 
 
479 aa  299  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  44.13 
 
 
476 aa  299  9e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.97 
 
 
482 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.16 
 
 
484 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.56 
 
 
487 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.42 
 
 
484 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.14 
 
 
505 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  38.43 
 
 
487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.85 
 
 
476 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.76 
 
 
487 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3211  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.24 
 
 
491 aa  280  5e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  45.24 
 
 
481 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0551  NADH dehydrogenase subunit N  41.31 
 
 
511 aa  277  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.170778 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.78 
 
 
479 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  35.51 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.9 
 
 
489 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.11 
 
 
475 aa  273  7e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
487 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>