More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1038 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0834  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  90.78 
 
 		 499 aa  822    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.748018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 		 499 aa  982    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 492 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  59.47 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  60.67 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  57.79 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  57.31 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  57.55 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  57.31 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  57.79 
 
 		 488 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  57.31 
 
 		 488 aa  478  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  58.99 
 
 		 485 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  55.74 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  57.42 
 
 		 491 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  59.71 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  55.5 
 
 		 490 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  51.97 
 
 		 494 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  51.18 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  52.1 
 
 		 495 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  50.69 
 
 		 493 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1437  NADH dehydrogenase subunit N  50.5 
 
 		 500 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  51.2 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0970  NADH dehydrogenase subunit N  51.29 
 
 		 497 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  50.89 
 
 		 497 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  51.68 
 
 		 495 aa  428  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  50.89 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2049  NADH dehydrogenase subunit N  52.58 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.141161  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1878  NADH dehydrogenase subunit N  56.59 
 
 		 491 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.39 
 
 		 482 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  52.39 
 
 		 483 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2201  NADH dehydrogenase subunit N  56.83 
 
 		 491 aa  422  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487391  normal  0.368629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  51.52 
 
 		 494 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  47.84 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  48.79 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0885  NADH dehydrogenase subunit N  51.09 
 
 		 497 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  45.66 
 
 		 482 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  50.83 
 
 		 489 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  45.66 
 
 		 482 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  45.49 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.03 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  52.03 
 
 		 481 aa  393  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.97 
 
 		 482 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  43.03 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  43.24 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  47.08 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.99 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.42 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  43.65 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  43.44 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.06 
 
 		 484 aa  342  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  43.71 
 
 		 487 aa  333  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.9 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  40.75 
 
 		 480 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  43.98 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.84 
 
 		 479 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  42.23 
 
 		 486 aa  312  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.94 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.4 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.26 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.4 
 
 		 479 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  38.34 
 
 		 476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  37.76 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  43.88 
 
 		 478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  43.88 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  40.91 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.35 
 
 		 477 aa  302  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  44.42 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  38.51 
 
 		 479 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.44 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  44.16 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  44 
 
 		 475 aa  299  9e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  38.31 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  37.96 
 
 		 478 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  37.78 
 
 		 482 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  39.74 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  38.99 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.32 
 
 		 477 aa  293  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  43.43 
 
 		 478 aa  291  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  40.79 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  40.09 
 
 		 483 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  40.64 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  37.71 
 
 		 478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.07 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.07 
 
 		 484 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  41.39 
 
 		 487 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  39.04 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  39.04 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36 
 
 		 484 aa  276  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.86 
 
 		 505 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  34.67 
 
 		 487 aa  274  3e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  38.02 
 
 		 478 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  41.79 
 
 		 481 aa  272  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  35.02 
 
 		 484 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>