More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1329 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  68.68 
 
 
478 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  73.08 
 
 
483 aa  667    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 
479 aa  936    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  67.99 
 
 
478 aa  630  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  68.06 
 
 
478 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  68.06 
 
 
478 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  66.74 
 
 
499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  56.49 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  57.27 
 
 
483 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  54.55 
 
 
480 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.57 
 
 
477 aa  444  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  54.19 
 
 
478 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  54.88 
 
 
478 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  55.41 
 
 
479 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  54.48 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  53.72 
 
 
478 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  50.96 
 
 
479 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  59.04 
 
 
475 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  55.48 
 
 
478 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  57.94 
 
 
479 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.96 
 
 
482 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.77 
 
 
479 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.88 
 
 
482 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.96 
 
 
479 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.96 
 
 
479 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.89 
 
 
477 aa  420  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  57.48 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.46 
 
 
481 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  57.48 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  53.76 
 
 
481 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  54.23 
 
 
481 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  55.86 
 
 
478 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  55.81 
 
 
487 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  52.06 
 
 
481 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.61 
 
 
480 aa  389  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  51.5 
 
 
478 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  50.9 
 
 
487 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  49.34 
 
 
476 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  50 
 
 
487 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  48.96 
 
 
475 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.44 
 
 
483 aa  342  7e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  41.93 
 
 
484 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2819  NADH dehydrogenase subunit N  44.74 
 
 
483 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.24 
 
 
487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.38 
 
 
487 aa  325  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.25 
 
 
484 aa  323  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.51 
 
 
484 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.51 
 
 
484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.65 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  45.87 
 
 
483 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  41.18 
 
 
485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  41.18 
 
 
485 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  39.4 
 
 
482 aa  302  9e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  42.6 
 
 
494 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  39.03 
 
 
482 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 
478 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  42.96 
 
 
481 aa  293  5e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0556  NADH dehydrogenase I, N subunit  34.8 
 
 
469 aa  291  2e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.17 
 
 
481 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  42.17 
 
 
481 aa  289  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  39.95 
 
 
490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  42.36 
 
 
489 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
480 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  39.32 
 
 
487 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  40.16 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  37.94 
 
 
492 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41 
 
 
479 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.44 
 
 
488 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  40.2 
 
 
490 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_002978  WD0969  NADH dehydrogenase I, N subunit, putative  37.77 
 
 
454 aa  282  9e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.314419  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
485 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
485 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
485 aa  280  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
490 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
490 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
490 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0474  proton-translocating NADH-quinoneoxidoreductase, chain N  36.06 
 
 
474 aa  280  4e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  39.9 
 
 
490 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.68 
 
 
481 aa  280  5e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  39.56 
 
 
493 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0987  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.3 
 
 
476 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.740525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  40.62 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  40.94 
 
 
489 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  40.62 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  40.94 
 
 
488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  40.62 
 
 
488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.78 
 
 
476 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.27 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  40.94 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  39.49 
 
 
478 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1303  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.59 
 
 
492 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346508  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  39.19 
 
 
491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  37.92 
 
 
486 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  41.44 
 
 
480 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  37.47 
 
 
497 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  41.18 
 
 
479 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  38.54 
 
 
476 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  39.21 
 
 
497 aa  264  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  39.48 
 
 
491 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  39.87 
 
 
500 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>