More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3622 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  100 
 
 
483 aa  949    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.93 
 
 
483 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.94 
 
 
477 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  46.75 
 
 
477 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  45.01 
 
 
476 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  49.14 
 
 
479 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  45.78 
 
 
478 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  46.07 
 
 
478 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  44.33 
 
 
478 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  45.01 
 
 
478 aa  384  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.88 
 
 
479 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  49.02 
 
 
478 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.45 
 
 
479 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  43.48 
 
 
478 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  45.34 
 
 
480 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.88 
 
 
479 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  48.77 
 
 
478 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.78 
 
 
482 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.26 
 
 
487 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  44.97 
 
 
475 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  43.31 
 
 
479 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  45.51 
 
 
479 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.71 
 
 
482 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.82 
 
 
484 aa  362  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  48.9 
 
 
478 aa  362  8e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.58 
 
 
481 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  44.79 
 
 
484 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.52 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.14 
 
 
484 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  49.32 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.72 
 
 
484 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  46.67 
 
 
481 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  43.38 
 
 
481 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1568  NADH dehydrogenase subunit N  49.63 
 
 
487 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  43.24 
 
 
482 aa  348  9e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  43.24 
 
 
482 aa  348  9e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  45.96 
 
 
476 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  42.53 
 
 
481 aa  347  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  43.44 
 
 
479 aa  342  7e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  40.42 
 
 
480 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  44.77 
 
 
478 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.46 
 
 
482 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.01 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  42.19 
 
 
483 aa  340  4e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0791  NADH dehydrogenase subunit N  44.24 
 
 
487 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.112616  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  45.39 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2998  NADH dehydrogenase subunit N  46.77 
 
 
481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0934  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.39 
 
 
478 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.56 
 
 
488 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  44.83 
 
 
481 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.83 
 
 
481 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2231  NADH dehydrogenase subunit N  44.55 
 
 
499 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  41.09 
 
 
490 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1368  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.28 
 
 
480 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  0.0278862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  41.33 
 
 
490 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  40.33 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1655  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.92 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  41.61 
 
 
478 aa  326  5e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  39.27 
 
 
478 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.2 
 
 
482 aa  324  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  39.96 
 
 
497 aa  323  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  39.67 
 
 
488 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  39.67 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  39.67 
 
 
488 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  39.29 
 
 
488 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  39.29 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  39.43 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  41.65 
 
 
478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  43.51 
 
 
478 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  43.51 
 
 
478 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  39.76 
 
 
494 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  38.53 
 
 
480 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  40.24 
 
 
485 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  40.05 
 
 
491 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
490 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
490 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
490 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
490 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
485 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
485 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  40.47 
 
 
485 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  38.11 
 
 
479 aa  316  5e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0970  NADH dehydrogenase subunit N  40.99 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  40.96 
 
 
495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  39.17 
 
 
492 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.14 
 
 
479 aa  310  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.01 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.14168  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  41.84 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  44.92 
 
 
487 aa  307  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  41.27 
 
 
497 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  41.38 
 
 
485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  37.47 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  40.77 
 
 
500 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1437  NADH dehydrogenase subunit N  41.67 
 
 
500 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3382  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.71 
 
 
498 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  40.77 
 
 
497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  39.51 
 
 
493 aa  302  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  40.35 
 
 
495 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.34 
 
 
476 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.92 
 
 
481 aa  299  7e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>