More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1514 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2800  NADH dehydrogenase subunit N  68.55 
 
 		 497 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.375762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1416  NADH dehydrogenase subunit N  75.51 
 
 		 494 aa  730    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.557478  normal  0.0209663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3497  NADH dehydrogenase subunit N  67.61 
 
 		 495 aa  651    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1506  NADH dehydrogenase subunit N  69.23 
 
 		 495 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.523912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3243  NADH dehydrogenase subunit N  68.74 
 
 		 500 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.279978  normal  0.713648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0970  NADH dehydrogenase subunit N  68.42 
 
 		 497 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  0.32361 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1514  NADH dehydrogenase subunit N  100 
 
 		 493 aa  975    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0500388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1276  NADH dehydrogenase subunit N  69.56 
 
 		 497 aa  675    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.22261  normal  0.209914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1437  NADH dehydrogenase subunit N  67.14 
 
 		 500 aa  631  1e-180  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5167  NADH dehydrogenase subunit N  68.35 
 
 		 497 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0885  NADH dehydrogenase subunit N  67.94 
 
 		 497 aa  609  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3201  NADH dehydrogenase subunit N  57.94 
 
 		 490 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1356  NADH dehydrogenase subunit N  57.73 
 
 		 490 aa  535  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00252031  normal  0.0117379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1074  NADH dehydrogenase subunit N  59.83 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1816  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.266253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0962  NADH dehydrogenase subunit N  56.76 
 
 		 494 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0470739  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1303  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1449  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0724  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.482677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0426  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.3165  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1143  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271552  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1312  NADH dehydrogenase subunit N  59.62 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1996  NADH dehydrogenase subunit N  58.96 
 
 		 492 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638246  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2274  NADH dehydrogenase subunit N  56.55 
 
 		 488 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2260  NADH dehydrogenase subunit N  56.9 
 
 		 488 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0940  NADH dehydrogenase subunit N  63.07 
 
 		 491 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.282337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1624  NADH dehydrogenase subunit N  56.9 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2236  NADH dehydrogenase subunit N  56.9 
 
 		 488 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5564  NADH dehydrogenase subunit N  57.11 
 
 		 489 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2153  NADH dehydrogenase subunit N  61.07 
 
 		 488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175496  normal  0.239653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0974  NADH dehydrogenase subunit N  62.53 
 
 		 491 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1041  NADH dehydrogenase subunit N  55.3 
 
 		 491 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  54.81 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2049  NADH dehydrogenase subunit N  58.43 
 
 		 490 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.141161  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2201  NADH dehydrogenase subunit N  58.02 
 
 		 491 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.487391  normal  0.368629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1155  NADH dehydrogenase subunit N  56.06 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.410866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1755  NADH dehydrogenase subunit N  53.7 
 
 		 489 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.97062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1878  NADH dehydrogenase subunit N  57.76 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1104  NADH dehydrogenase subunit N  53.59 
 
 		 481 aa  465  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0999  NADH dehydrogenase subunit N  52.27 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1604  NADH dehydrogenase subunit N  48.46 
 
 		 482 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0559  NADH dehydrogenase subunit N  48.46 
 
 		 482 aa  438  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0721  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  53.29 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.733777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2617  NADH-quinone oxidoreductase, N subunit  52.37 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.769901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2244  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  52.37 
 
 		 481 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.384307  hitchhiker  0.00132093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0830  NADH dehydrogenase subunit N  48.12 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0834  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.61 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.748018 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  50.69 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1957  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.27 
 
 		 488 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608114 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2552  NADH dehydrogenase subunit N  51.16 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.591844  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1951  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.9 
 
 		 481 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.172883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2823  NADH dehydrogenase subunit N  44.44 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2692  NADH dehydrogenase subunit N  44.44 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1752  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  49.69 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0253  NADH dehydrogenase subunit N  45.28 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0282  NADH dehydrogenase subunit N  45.07 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01300  NADH dehydrogenase subunit N  45.07 
 
 		 487 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2818  NADH dehydrogenase subunit N  47.27 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4620  NADH dehydrogenase subunit N  42.17 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0903  NADH dehydrogenase subunit N  40.54 
 
 		 480 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.33 
 
 		 483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.175572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.34 
 
 		 483 aa  326  5e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149081  normal  0.0891117 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2385  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  44.36 
 
 		 477 aa  324  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.644113  normal  0.998345 
 
 
-
 
NC_004310  BR0815  NADH dehydrogenase subunit N  43.34 
 
 		 478 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.185005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1035  NADH dehydrogenase subunit N  41.51 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633564  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0810  NADH dehydrogenase subunit N  43.2 
 
 		 478 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4548  NADH dehydrogenase subunit N  42.12 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4403  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.69 
 
 		 482 aa  317  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.511362 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1874  NADH dehydrogenase subunit N  42.07 
 
 		 478 aa  316  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.687941  normal  0.163647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3285  NADH dehydrogenase subunit N  41.81 
 
 		 479 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.917903  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2207  NADH dehydrogenase subunit N  40.61 
 
 		 478 aa  316  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2410  NADH dehydrogenase subunit N  43.96 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0625167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3125  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.4 
 
 		 487 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0998153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  43.38 
 
 		 477 aa  312  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3913  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.38 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00947726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2587  NADH dehydrogenase subunit N  40 
 
 		 478 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.43534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.11 
 
 		 484 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000145743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4231  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.69 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0521888  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1729  NADH dehydrogenase subunit N  42.04 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.31279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2872  NADH dehydrogenase subunit N  40.64 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.562187  normal  0.277076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2046  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  41.01 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.435365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1296  NADH dehydrogenase subunit N  41.99 
 
 		 476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.740418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2417  NADH dehydrogenase subunit N  42.33 
 
 		 478 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150272  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1274  NADH dehydrogenase subunit N  42.43 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4139  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  45.69 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1366  NADH dehydrogenase subunit N  41.97 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3342  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  36.53 
 
 		 484 aa  296  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.572203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2036  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  42.19 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1072  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.43 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.343955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1201  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  40.43 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1006  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.95 
 
 		 479 aa  292  9e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0667642  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2287  NADH dehydrogenase subunit N  40.99 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1991  NADH dehydrogenase subunit N  38.66 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0351  NADH dehydrogenase I, N subunit  36.3 
 
 		 484 aa  289  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3340  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  39.07 
 
 		 475 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.871003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0760  NADH dehydrogenase subunit N  41.45 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1329  NADH dehydrogenase subunit N  39.96 
 
 		 479 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1191  NADH dehydrogenase subunit N  38.24 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2530  NADH dehydrogenase subunit N  38.24 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0352913  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1196  NADH dehydrogenase subunit N  42.82 
 
 		 483 aa  286  9e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>