11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3670 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3670  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  423  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  hitchhiker  0.00674284 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4413  hypothetical protein  47.68 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0546  hypothetical protein  46.26 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0477  hypothetical protein  46.26 
 
 		 181 aa  141  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4333  protein of unknown function DUF995  43.29 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0039644  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4004  protein of unknown function DUF995  42.17 
 
 		 175 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0205  protein of unknown function DUF995  42.75 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32985  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3668  hypothetical protein  38.27 
 
 		 169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.568701  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4411  hypothetical protein  41.8 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.331089  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0548  hypothetical protein  35.78 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0479  hypothetical protein  35.78 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>