12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3668 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3668  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.568701  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0205  protein of unknown function DUF995  60.25 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32985  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4333  protein of unknown function DUF995  44.79 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0039644  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4004  protein of unknown function DUF995  42.77 
 
 		 175 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0546  hypothetical protein  41.42 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0477  hypothetical protein  41.42 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3670  hypothetical protein  39.24 
 
 		 204 aa  124  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  hitchhiker  0.00674284 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4411  hypothetical protein  50.82 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.331089  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4413  hypothetical protein  45.77 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0548  hypothetical protein  40.69 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0479  hypothetical protein  40.69 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0501  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405212  normal  0.377015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>