12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4004 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4004  protein of unknown function DUF995  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4333  protein of unknown function DUF995  81.71 
 
 		 173 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0039644  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3668  hypothetical protein  46.27 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.568701  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0205  protein of unknown function DUF995  45.99 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32985  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3670  hypothetical protein  42.17 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  hitchhiker  0.00674284 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0546  hypothetical protein  37.93 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0477  hypothetical protein  37.93 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4413  hypothetical protein  43.75 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0548  hypothetical protein  47.27 
 
 		 205 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0479  hypothetical protein  47.27 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4411  hypothetical protein  43.36 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.331089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0501  hypothetical protein  25.74 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405212  normal  0.377015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>