12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4333 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4333  protein of unknown function DUF995  100 
 
 
173 aa  358  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0039644  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4004  protein of unknown function DUF995  81.71 
 
 
175 aa  291  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3670  hypothetical protein  43.29 
 
 
204 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  hitchhiker  0.00674284 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3668  hypothetical protein  45.99 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.568701  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0205  protein of unknown function DUF995  43.92 
 
 
169 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32985  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0546  hypothetical protein  44.36 
 
 
181 aa  121  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0477  hypothetical protein  44.36 
 
 
181 aa  121  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4413  hypothetical protein  43.75 
 
 
189 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0548  hypothetical protein  45.45 
 
 
205 aa  101  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0479  hypothetical protein  45.45 
 
 
164 aa  101  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4411  hypothetical protein  45.05 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.331089  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0501  hypothetical protein  26.14 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405212  normal  0.377015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>