11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0548 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0548  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0479  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.678865  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4411  hypothetical protein  58.9 
 
 
172 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.331089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0205  protein of unknown function DUF995  45.39 
 
 
169 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32985  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4004  protein of unknown function DUF995  46.88 
 
 
175 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0546  hypothetical protein  38.22 
 
 
181 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0477  hypothetical protein  38.22 
 
 
181 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3668  hypothetical protein  45.3 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.568701  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4333  protein of unknown function DUF995  42.76 
 
 
173 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0039644  hitchhiker  0.00658828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4413  hypothetical protein  41.78 
 
 
189 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3670  hypothetical protein  32.5 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.575498  hitchhiker  0.00674284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>