196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3641 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  61.23 
 
 		 562 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  64.81 
 
 		 593 aa  795    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  100 
 
 		 595 aa  1214    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  73.04 
 
 		 597 aa  899    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  55.46 
 
 		 569 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  56.52 
 
 		 571 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  54.97 
 
 		 593 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  54.36 
 
 		 582 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 		 588 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  54.1 
 
 		 582 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  53.27 
 
 		 584 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  54.14 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  54.14 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  54.14 
 
 		 594 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  53.31 
 
 		 579 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  53.45 
 
 		 585 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  53.56 
 
 		 612 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  53.82 
 
 		 585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  52.35 
 
 		 581 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  53.14 
 
 		 609 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  50.83 
 
 		 578 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  50.72 
 
 		 588 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  54.28 
 
 		 579 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  52.12 
 
 		 581 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  52.12 
 
 		 581 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  53.33 
 
 		 572 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  51.74 
 
 		 584 aa  551  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  53.36 
 
 		 581 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0916  glutathione synthase  53.03 
 
 		 616 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  51.61 
 
 		 581 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  34.69 
 
 		 895 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  34.38 
 
 		 896 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  33.96 
 
 		 906 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  34.7 
 
 		 861 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  33.86 
 
 		 875 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  30.31 
 
 		 894 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  32.92 
 
 		 881 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  33.65 
 
 		 910 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  33.75 
 
 		 879 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  33.54 
 
 		 861 aa  145  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  30 
 
 		 893 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  30.46 
 
 		 876 aa  144  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  33.54 
 
 		 861 aa  144  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  33.23 
 
 		 858 aa  143  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  31.37 
 
 		 918 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  32.4 
 
 		 879 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  33.78 
 
 		 856 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  34.68 
 
 		 855 aa  140  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  31.27 
 
 		 900 aa  140  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  30.91 
 
 		 857 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  29.97 
 
 		 885 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  33.67 
 
 		 856 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  30.28 
 
 		 882 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  30.49 
 
 		 908 aa  135  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  28.19 
 
 		 874 aa  135  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  31.15 
 
 		 939 aa  134  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  30.58 
 
 		 902 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  33.89 
 
 		 855 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  33.89 
 
 		 855 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  29.85 
 
 		 901 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  34.01 
 
 		 856 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  28.52 
 
 		 874 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  30.98 
 
 		 877 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  30.98 
 
 		 877 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  30.18 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  32.08 
 
 		 862 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  33.12 
 
 		 890 aa  128  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  30.19 
 
 		 751 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  32.66 
 
 		 855 aa  120  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  30.14 
 
 		 741 aa  120  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  29.19 
 
 		 856 aa  120  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  28.33 
 
 		 894 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  31.41 
 
 		 790 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  30.03 
 
 		 748 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  30.5 
 
 		 878 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  27.91 
 
 		 887 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  31.13 
 
 		 746 aa  117  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  26.71 
 
 		 328 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.65 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  29.69 
 
 		 871 aa  115  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  32.77 
 
 		 865 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  28.44 
 
 		 730 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  30.43 
 
 		 637 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  30.5 
 
 		 872 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  30.89 
 
 		 722 aa  113  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  29.28 
 
 		 755 aa  113  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  31.91 
 
 		 664 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.08 
 
 		 778 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  24.77 
 
 		 778 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  27.57 
 
 		 723 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  27.27 
 
 		 723 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  28.73 
 
 		 636 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  27.27 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  26.99 
 
 		 622 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  30.09 
 
 		 883 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  26.19 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  30.53 
 
 		 727 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  28.49 
 
 		 743 aa  107  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.21 
 
 		 573 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  29.25 
 
 		 886 aa  107  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>