More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5803 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  39.34 
 
 
893 aa  643    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  45.09 
 
 
939 aa  748    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  44.56 
 
 
918 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  45.58 
 
 
879 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  45.73 
 
 
877 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  48.65 
 
 
914 aa  781    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  100 
 
 
910 aa  1843    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  44.36 
 
 
900 aa  680    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  45.51 
 
 
877 aa  723    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  44.36 
 
 
901 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  48.03 
 
 
908 aa  775    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  42.89 
 
 
876 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  43.42 
 
 
879 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  48.69 
 
 
894 aa  813    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  40.96 
 
 
882 aa  664    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  44.28 
 
 
902 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  39.8 
 
 
887 aa  647    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  42.38 
 
 
906 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  42.76 
 
 
895 aa  653    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  40.2 
 
 
885 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  39.16 
 
 
894 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  41.94 
 
 
856 aa  598  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.69 
 
 
881 aa  590  1e-167  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  40.66 
 
 
856 aa  588  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  41.69 
 
 
875 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  41.34 
 
 
896 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  41.38 
 
 
855 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  40.38 
 
 
857 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  41.55 
 
 
856 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  41.09 
 
 
865 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  40.78 
 
 
890 aa  573  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  41.59 
 
 
856 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  38.22 
 
 
858 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  35.96 
 
 
874 aa  566  1e-160  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  41.66 
 
 
861 aa  568  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  41.49 
 
 
861 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  35.45 
 
 
874 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  41.6 
 
 
861 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  43.83 
 
 
855 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  43.83 
 
 
855 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  41.99 
 
 
855 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  37.93 
 
 
871 aa  540  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  41.08 
 
 
862 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  37.21 
 
 
878 aa  511  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  41.7 
 
 
872 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  35.46 
 
 
886 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  35.46 
 
 
886 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  40.57 
 
 
730 aa  465  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  38.05 
 
 
746 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  36.07 
 
 
883 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  39.76 
 
 
755 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  37.83 
 
 
743 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  39.11 
 
 
741 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  34.64 
 
 
751 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  37.19 
 
 
744 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  37.6 
 
 
723 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  37.48 
 
 
723 aa  416  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  37.18 
 
 
727 aa  416  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  36.98 
 
 
730 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  37.22 
 
 
727 aa  412  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  39.1 
 
 
748 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  37.48 
 
 
722 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  34.1 
 
 
622 aa  246  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  32.51 
 
 
637 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.25 
 
 
664 aa  223  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  43.04 
 
 
576 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  29.93 
 
 
636 aa  221  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  37.69 
 
 
538 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  32.92 
 
 
646 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  29.44 
 
 
560 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  35.44 
 
 
328 aa  187  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.18 
 
 
778 aa  181  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.86 
 
 
778 aa  180  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  30.53 
 
 
1086 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.88 
 
 
741 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  31.9 
 
 
427 aa  173  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  30 
 
 
584 aa  167  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  37.25 
 
 
725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.94 
 
 
571 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.3 
 
 
647 aa  157  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.42 
 
 
755 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.08 
 
 
755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  33.44 
 
 
597 aa  155  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.57 
 
 
757 aa  154  5.9999999999999996e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 
1103 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
593 aa  153  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29 
 
 
573 aa  152  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.93 
 
 
594 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.84 
 
 
578 aa  149  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  33.65 
 
 
595 aa  149  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
588 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
594 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
594 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
594 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  34.91 
 
 
569 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  26.68 
 
 
441 aa  145  4e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
588 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.79 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  35.51 
 
 
585 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>