More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2477 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  46.59 
 
 
893 aa  751    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  46.56 
 
 
876 aa  775    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  100 
 
 
874 aa  1755    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  97.71 
 
 
874 aa  1718    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  43.88 
 
 
882 aa  715    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  43.63 
 
 
887 aa  702    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  38.58 
 
 
881 aa  622  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.72 
 
 
894 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  39.6 
 
 
885 aa  609  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.33 
 
 
894 aa  578  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  38.65 
 
 
879 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  35.41 
 
 
906 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  37.87 
 
 
877 aa  554  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  37.76 
 
 
877 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  35.83 
 
 
895 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  35.78 
 
 
918 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  36.99 
 
 
901 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  35.96 
 
 
910 aa  545  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  38.15 
 
 
902 aa  540  9.999999999999999e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.34 
 
 
900 aa  535  1e-150  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  35.38 
 
 
914 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  36.79 
 
 
856 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  33.44 
 
 
908 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.44 
 
 
939 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  34.7 
 
 
875 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  34.4 
 
 
879 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  35.56 
 
 
861 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  35.56 
 
 
861 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  34.66 
 
 
857 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  34.43 
 
 
856 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  34.64 
 
 
858 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  36.24 
 
 
856 aa  490  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  34.68 
 
 
855 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  34.3 
 
 
856 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  34.72 
 
 
865 aa  485  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  34.23 
 
 
861 aa  475  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  36.51 
 
 
855 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  32.95 
 
 
890 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  36.51 
 
 
855 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  36.38 
 
 
855 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  33.88 
 
 
871 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  33.77 
 
 
896 aa  449  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  34.11 
 
 
862 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  31.37 
 
 
878 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  33 
 
 
872 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  30.27 
 
 
886 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  30.27 
 
 
886 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  31.06 
 
 
883 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  32.83 
 
 
755 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  32.05 
 
 
751 aa  363  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  30.97 
 
 
727 aa  359  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  31.16 
 
 
741 aa  357  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  30.4 
 
 
723 aa  348  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  31.4 
 
 
746 aa  342  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  29.61 
 
 
723 aa  339  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  30.31 
 
 
730 aa  337  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  31.91 
 
 
730 aa  337  5.999999999999999e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  29.63 
 
 
722 aa  337  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  29.31 
 
 
743 aa  336  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  29.44 
 
 
727 aa  335  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  30.3 
 
 
744 aa  327  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  31.21 
 
 
748 aa  321  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  34.44 
 
 
560 aa  237  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  24.51 
 
 
741 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.33 
 
 
622 aa  211  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  29.33 
 
 
637 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  31.22 
 
 
538 aa  201  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  31.27 
 
 
584 aa  196  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.91 
 
 
636 aa  190  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.5 
 
 
646 aa  170  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  27.8 
 
 
664 aa  169  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  25.3 
 
 
573 aa  159  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  32.76 
 
 
576 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.75 
 
 
647 aa  152  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  30.72 
 
 
597 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.93 
 
 
778 aa  146  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.57 
 
 
778 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  26.74 
 
 
427 aa  141  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.46 
 
 
328 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
593 aa  139  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  30.56 
 
 
340 aa  138  5e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  30.56 
 
 
340 aa  138  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.19 
 
 
757 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  28.52 
 
 
595 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  29.06 
 
 
571 aa  131  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.47 
 
 
584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  30 
 
 
612 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.88 
 
 
578 aa  129  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  29.62 
 
 
585 aa  128  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.46 
 
 
755 aa  127  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.7 
 
 
569 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  27.52 
 
 
584 aa  126  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.09 
 
 
755 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
562 aa  124  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
593 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  30.42 
 
 
588 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  26.82 
 
 
441 aa  122  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  29.62 
 
 
585 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  28.83 
 
 
572 aa  120  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.65 
 
 
754 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>