More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2204 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  40.96 
 
 		 910 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  60.55 
 
 		 893 aa  1062    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  45.26 
 
 		 885 aa  730    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  42.37 
 
 		 918 aa  654    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  44.15 
 
 		 881 aa  715    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.57 
 
 		 914 aa  669    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  43.37 
 
 		 901 aa  658    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  42.3 
 
 		 877 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 882 aa  1786    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  42.56 
 
 		 879 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  54.7 
 
 		 876 aa  949    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  43.73 
 
 		 900 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  44.01 
 
 		 894 aa  716    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  43.88 
 
 		 874 aa  737    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  43.88 
 
 		 874 aa  732    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  43.1 
 
 		 902 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  42.3 
 
 		 877 aa  669    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  54.2 
 
 		 887 aa  984    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  41.46 
 
 		 908 aa  669    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  43.59 
 
 		 894 aa  719    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  40.66 
 
 		 879 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  38.89 
 
 		 939 aa  614  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  40.21 
 
 		 906 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  40.87 
 
 		 865 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  39.89 
 
 		 861 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  39.77 
 
 		 861 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  38.72 
 
 		 890 aa  582  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  38.51 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  38.12 
 
 		 857 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  37.63 
 
 		 895 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  38.13 
 
 		 875 aa  574  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  37.59 
 
 		 896 aa  574  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  38.5 
 
 		 856 aa  572  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  41.34 
 
 		 855 aa  567  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  38.09 
 
 		 858 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  38.51 
 
 		 861 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  38.54 
 
 		 871 aa  566  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  39.18 
 
 		 856 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  39.24 
 
 		 856 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  39.33 
 
 		 856 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 		 862 aa  549  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 		 855 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 		 855 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  35.09 
 
 		 878 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 		 872 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  35.15 
 
 		 886 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  35.15 
 
 		 886 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  38.53 
 
 		 755 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  34.5 
 
 		 883 aa  479  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  35.94 
 
 		 727 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  35.95 
 
 		 741 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  35.2 
 
 		 743 aa  458  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  35.24 
 
 		 730 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  34.15 
 
 		 730 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  35.76 
 
 		 746 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  34.97 
 
 		 723 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  35.34 
 
 		 751 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  34.96 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  34.63 
 
 		 727 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  34.41 
 
 		 744 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  34.36 
 
 		 722 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  33.83 
 
 		 748 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  36.81 
 
 		 560 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  28.12 
 
 		 741 aa  251  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  34.34 
 
 		 538 aa  224  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.65 
 
 		 622 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  32.48 
 
 		 636 aa  214  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.19 
 
 		 664 aa  204  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  32.66 
 
 		 427 aa  203  9e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  34.25 
 
 		 584 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  37.37 
 
 		 576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.92 
 
 		 646 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  35.54 
 
 		 637 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  38.29 
 
 		 328 aa  194  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  37.31 
 
 		 755 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  37.31 
 
 		 755 aa  191  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  38.57 
 
 		 725 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  36.62 
 
 		 778 aa  184  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  36.2 
 
 		 778 aa  180  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  28.47 
 
 		 1086 aa  172  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.53 
 
 		 757 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  25.82 
 
 		 573 aa  162  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.18 
 
 		 647 aa  160  7e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  39.93 
 
 		 594 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  32.56 
 
 		 340 aa  160  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  32.23 
 
 		 340 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.51 
 
 		 571 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 593 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  30.22 
 
 		 441 aa  155  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.23 
 
 		 584 aa  155  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.65 
 
 		 569 aa  154  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 1103 aa  154  8.999999999999999e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 594 aa  151  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 594 aa  151  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 		 594 aa  151  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 585 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  32.4 
 
 		 579 aa  149  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.32 
 
 		 578 aa  148  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.21 
 
 		 584 aa  146  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 582 aa  145  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>