192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0815 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  100 
 
 
572 aa  1161    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  54.5 
 
 
593 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  57.38 
 
 
571 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  53.64 
 
 
588 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  55.92 
 
 
585 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  56.91 
 
 
569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  56.25 
 
 
579 aa  569  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  56.28 
 
 
585 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  53.99 
 
 
582 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  52.61 
 
 
595 aa  561  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  53.99 
 
 
582 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  50.61 
 
 
597 aa  557  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  53.64 
 
 
581 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  53.68 
 
 
562 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  51.87 
 
 
578 aa  555  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  55.06 
 
 
588 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  53.75 
 
 
593 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  54.65 
 
 
579 aa  544  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  52.9 
 
 
581 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  52.9 
 
 
581 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  52.21 
 
 
612 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
594 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
594 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
594 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  51.74 
 
 
584 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  53.62 
 
 
581 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  51.55 
 
 
584 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0916  glutathione synthase  52.02 
 
 
616 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  52.54 
 
 
581 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  50.78 
 
 
609 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 
879 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  36.43 
 
 
861 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  33.99 
 
 
875 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  32.47 
 
 
885 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  32.05 
 
 
895 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  33.79 
 
 
896 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  34.87 
 
 
861 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  31.61 
 
 
894 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  34.54 
 
 
861 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  32.08 
 
 
855 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  29.27 
 
 
857 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  32.08 
 
 
855 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  35.96 
 
 
856 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  30.58 
 
 
876 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  30.64 
 
 
856 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  33.54 
 
 
881 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  33.57 
 
 
856 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  30.23 
 
 
918 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  31.63 
 
 
882 aa  131  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  29.35 
 
 
893 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  30.06 
 
 
902 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  33.22 
 
 
886 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  33.22 
 
 
886 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  31.09 
 
 
901 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  32.4 
 
 
878 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  29.04 
 
 
856 aa  126  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  32 
 
 
858 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  32.99 
 
 
910 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  30.89 
 
 
900 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  31.29 
 
 
887 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  31.49 
 
 
939 aa  123  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  27.38 
 
 
874 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  31.31 
 
 
879 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  32.32 
 
 
727 aa  121  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  30.03 
 
 
877 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 
862 aa  120  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  28.62 
 
 
874 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  29.71 
 
 
877 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  31.02 
 
 
746 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  31.29 
 
 
855 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  29.21 
 
 
743 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  31.78 
 
 
883 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  33.46 
 
 
855 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  30.86 
 
 
914 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  26.34 
 
 
730 aa  117  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  33.46 
 
 
890 aa  116  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  31.62 
 
 
906 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  31.86 
 
 
865 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.98 
 
 
755 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  28.03 
 
 
908 aa  113  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.5 
 
 
573 aa  113  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  29.91 
 
 
755 aa  113  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.69 
 
 
754 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  30.41 
 
 
871 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  27.55 
 
 
894 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  27.3 
 
 
741 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.38 
 
 
755 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  32.99 
 
 
872 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.32 
 
 
778 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  27.86 
 
 
723 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  26.86 
 
 
727 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  26.86 
 
 
723 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  33.97 
 
 
637 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  30.82 
 
 
722 aa  107  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  27.63 
 
 
730 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.99 
 
 
778 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  29.07 
 
 
328 aa  106  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  27.68 
 
 
748 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  23.58 
 
 
757 aa  103  7e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  27.25 
 
 
744 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>