More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4854 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  44.66 
 
 		 877 aa  732    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  47.25 
 
 		 939 aa  796    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  41.57 
 
 		 895 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  45.68 
 
 		 918 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  42.37 
 
 		 876 aa  711    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  44.22 
 
 		 885 aa  663    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  44.6 
 
 		 901 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  44.55 
 
 		 877 aa  731    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.78 
 
 		 906 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  41.57 
 
 		 882 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  44.16 
 
 		 879 aa  651    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  48.65 
 
 		 910 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 914 aa  1851    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  61.85 
 
 		 908 aa  1061    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  43.54 
 
 		 902 aa  699    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  45.69 
 
 		 879 aa  728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  49.44 
 
 		 894 aa  830    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  39.75 
 
 		 887 aa  646    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  44.67 
 
 		 900 aa  696    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  40.07 
 
 		 893 aa  628  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  40.05 
 
 		 894 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  42.34 
 
 		 857 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  42.5 
 
 		 856 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  41.63 
 
 		 896 aa  592  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  42.44 
 
 		 855 aa  585  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  42.56 
 
 		 865 aa  580  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.18 
 
 		 881 aa  580  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  42.17 
 
 		 856 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  41.88 
 
 		 856 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  41.44 
 
 		 871 aa  570  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  41.26 
 
 		 875 aa  568  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  41.45 
 
 		 861 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  41.45 
 
 		 861 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  40 
 
 		 858 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  41.81 
 
 		 890 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  41.38 
 
 		 855 aa  551  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  41.6 
 
 		 856 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  35.27 
 
 		 874 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  41.18 
 
 		 861 aa  545  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  41.21 
 
 		 862 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  35.38 
 
 		 874 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  41.11 
 
 		 855 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  38.58 
 
 		 878 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  41.11 
 
 		 855 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  40.83 
 
 		 872 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  37.6 
 
 		 886 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  38.51 
 
 		 883 aa  502  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  37.6 
 
 		 886 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  39.13 
 
 		 746 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  39.07 
 
 		 743 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  39.43 
 
 		 730 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  37.91 
 
 		 751 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  38.86 
 
 		 723 aa  436  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  37.99 
 
 		 748 aa  435  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  38.35 
 
 		 727 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  39.52 
 
 		 755 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  37.28 
 
 		 730 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  37.48 
 
 		 723 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  38.8 
 
 		 722 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  37.05 
 
 		 727 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  36.95 
 
 		 741 aa  420  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  40.26 
 
 		 744 aa  416  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  38.52 
 
 		 664 aa  228  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.18 
 
 		 622 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  35.41 
 
 		 646 aa  217  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  33.25 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  31.61 
 
 		 560 aa  210  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.21 
 
 		 636 aa  210  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.17 
 
 		 584 aa  197  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  39.59 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  35.18 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  32.41 
 
 		 427 aa  188  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  36.02 
 
 		 328 aa  174  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  24.06 
 
 		 741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 1103 aa  165  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.71 
 
 		 647 aa  162  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.51 
 
 		 584 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.89 
 
 		 778 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  33.11 
 
 		 1086 aa  157  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.87 
 
 		 757 aa  157  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.27 
 
 		 778 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  34.85 
 
 		 579 aa  155  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  35.03 
 
 		 725 aa  155  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 588 aa  155  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 582 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  34.65 
 
 		 582 aa  151  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  35.37 
 
 		 581 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 		 581 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  24.73 
 
 		 573 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  36.25 
 
 		 585 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.29 
 
 		 755 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  35.76 
 
 		 581 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  35.98 
 
 		 581 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  35.76 
 
 		 581 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  33.74 
 
 		 579 aa  147  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.67 
 
 		 755 aa  147  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  36.36 
 
 		 585 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.31 
 
 		 571 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.43 
 
 		 594 aa  145  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.89 
 
 		 754 aa  144  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>