More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1005 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  100 
 
 
862 aa  1733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  75.44 
 
 
861 aa  1248    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  53.95 
 
 
896 aa  874    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  72.98 
 
 
855 aa  1177    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  75.35 
 
 
861 aa  1278    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  68.38 
 
 
857 aa  1172    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  44.38 
 
 
878 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  71.75 
 
 
856 aa  1217    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  49.75 
 
 
871 aa  736    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  73.54 
 
 
890 aa  1222    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  64.8 
 
 
856 aa  1097    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  65.22 
 
 
856 aa  1103    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 
886 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 
886 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  71.58 
 
 
858 aa  1224    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  74.79 
 
 
875 aa  1268    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  84.98 
 
 
872 aa  1373    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  76.34 
 
 
865 aa  1276    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  71.86 
 
 
856 aa  1192    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  44.16 
 
 
883 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  78.05 
 
 
855 aa  1269    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  72.98 
 
 
855 aa  1177    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  75.47 
 
 
861 aa  1280    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  77.46 
 
 
855 aa  1294    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  39.72 
 
 
876 aa  631  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  40.38 
 
 
895 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.42 
 
 
894 aa  591  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  39.37 
 
 
882 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.64 
 
 
894 aa  591  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  38.7 
 
 
887 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.05 
 
 
906 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.21 
 
 
914 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  42.22 
 
 
908 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  39.93 
 
 
902 aa  576  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  38.17 
 
 
893 aa  560  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.08 
 
 
910 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  42.84 
 
 
879 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.8 
 
 
885 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.9 
 
 
918 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  39.63 
 
 
877 aa  552  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  39.52 
 
 
877 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.68 
 
 
901 aa  540  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.62 
 
 
881 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.68 
 
 
879 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  43.11 
 
 
746 aa  529  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.91 
 
 
900 aa  526  1e-147  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  39.07 
 
 
939 aa  520  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  41.46 
 
 
751 aa  504  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  42.38 
 
 
722 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  44.78 
 
 
755 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.11 
 
 
874 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  33.88 
 
 
874 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  41.66 
 
 
743 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  39.59 
 
 
727 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  40.3 
 
 
741 aa  482  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  39.92 
 
 
723 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  39.08 
 
 
730 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  38.04 
 
 
730 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  40.16 
 
 
744 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  37.83 
 
 
723 aa  444  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  41.57 
 
 
748 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  37.76 
 
 
727 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  29.72 
 
 
622 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  32.95 
 
 
646 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  32.07 
 
 
636 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.43 
 
 
637 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  30.61 
 
 
560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  32.79 
 
 
664 aa  197  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.92 
 
 
778 aa  197  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.92 
 
 
778 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  35.79 
 
 
538 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.81 
 
 
741 aa  193  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.33 
 
 
584 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  40.55 
 
 
576 aa  187  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  34.81 
 
 
757 aa  185  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.35 
 
 
573 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.37 
 
 
755 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.63 
 
 
755 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32.62 
 
 
328 aa  169  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  30.52 
 
 
647 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.9 
 
 
754 aa  159  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 
593 aa  158  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
594 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
594 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.31 
 
 
593 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  35.65 
 
 
594 aa  156  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
1103 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  36.59 
 
 
581 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  36.16 
 
 
597 aa  154  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.06 
 
 
585 aa  150  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.38 
 
 
578 aa  147  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  36.25 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.4 
 
 
750 aa  147  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
562 aa  147  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  35.19 
 
 
581 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.9 
 
 
1086 aa  146  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
588 aa  146  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  35.19 
 
 
581 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  28.31 
 
 
427 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.65 
 
 
571 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>