More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1871 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  40.5 
 
 		 895 aa  639    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  43.26 
 
 		 877 aa  682    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 939 aa  1936    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  44.34 
 
 		 918 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  45.06 
 
 		 901 aa  680    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  41.86 
 
 		 876 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  44.63 
 
 		 910 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  47.25 
 
 		 914 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  43.42 
 
 		 879 aa  685    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  43.84 
 
 		 900 aa  664    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  57.67 
 
 		 894 aa  1003    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 		 877 aa  681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  41.93 
 
 		 902 aa  657    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  43.6 
 
 		 908 aa  727    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  40.97 
 
 		 879 aa  596  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  39.86 
 
 		 906 aa  595  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.89 
 
 		 882 aa  592  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  39.17 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  36.76 
 
 		 887 aa  579  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.44 
 
 		 894 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  36.99 
 
 		 893 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  37.43 
 
 		 881 aa  549  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  40.86 
 
 		 856 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  38.52 
 
 		 896 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  35.44 
 
 		 874 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  35.44 
 
 		 874 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  37.12 
 
 		 871 aa  513  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  38.31 
 
 		 856 aa  508  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  37.32 
 
 		 858 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  38.53 
 
 		 855 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  40.44 
 
 		 857 aa  505  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  40.84 
 
 		 865 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  37.23 
 
 		 890 aa  495  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  38.57 
 
 		 856 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  37.97 
 
 		 875 aa  496  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  36.27 
 
 		 878 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  39.02 
 
 		 861 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  37.23 
 
 		 856 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  38.31 
 
 		 855 aa  482  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  38.9 
 
 		 861 aa  482  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  38.31 
 
 		 855 aa  482  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  37.46 
 
 		 861 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  39.07 
 
 		 862 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  38.95 
 
 		 855 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  35.82 
 
 		 883 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  35.11 
 
 		 886 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  35.11 
 
 		 886 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  38.97 
 
 		 872 aa  445  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  35.73 
 
 		 746 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  36.3 
 
 		 730 aa  405  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  37.81 
 
 		 722 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  36.5 
 
 		 755 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  35.21 
 
 		 723 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  35.65 
 
 		 727 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  35.21 
 
 		 743 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  33.69 
 
 		 741 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  34.92 
 
 		 751 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  34.06 
 
 		 730 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  33.79 
 
 		 723 aa  373  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  33.87 
 
 		 727 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  36.1 
 
 		 748 aa  365  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  34.33 
 
 		 744 aa  358  3.9999999999999996e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.61 
 
 		 622 aa  240  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  34.58 
 
 		 427 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  31.58 
 
 		 636 aa  227  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.12 
 
 		 664 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  30.57 
 
 		 637 aa  214  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  32.57 
 
 		 584 aa  204  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  32.67 
 
 		 538 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  32.05 
 
 		 646 aa  197  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  31.47 
 
 		 560 aa  193  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  38.11 
 
 		 725 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  38.32 
 
 		 576 aa  176  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.09 
 
 		 573 aa  173  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  24.4 
 
 		 741 aa  170  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32 
 
 		 778 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.25 
 
 		 778 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  34.35 
 
 		 647 aa  154  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.62 
 
 		 757 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.23 
 
 		 328 aa  149  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.05 
 
 		 755 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.05 
 
 		 755 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  33.02 
 
 		 579 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  28.66 
 
 		 441 aa  144  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 1103 aa  142  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 		 588 aa  142  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  33.43 
 
 		 585 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 		 588 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 593 aa  140  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.42 
 
 		 750 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  32.23 
 
 		 581 aa  138  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  32.23 
 
 		 579 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  29.14 
 
 		 1086 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.15 
 
 		 578 aa  137  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 		 582 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 594 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 594 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 		 594 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  31.04 
 
 		 582 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>