More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1058 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  75.29 
 
 		 861 aa  1276    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  62.18 
 
 		 856 aa  1052    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  75.41 
 
 		 861 aa  1276    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  68.73 
 
 		 857 aa  1177    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  70.09 
 
 		 856 aa  1196    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  54.39 
 
 		 896 aa  904    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  74.07 
 
 		 890 aa  1233    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  64.76 
 
 		 856 aa  1100    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 855 aa  1717    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  77.78 
 
 		 855 aa  1273    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  68.46 
 
 		 858 aa  1163    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  77.49 
 
 		 872 aa  1238    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  70.26 
 
 		 856 aa  1170    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  74.18 
 
 		 861 aa  1239    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  76.22 
 
 		 865 aa  1278    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  48.87 
 
 		 871 aa  709    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  71.08 
 
 		 855 aa  1157    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  73.89 
 
 		 875 aa  1261    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  71.08 
 
 		 855 aa  1157    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  77.46 
 
 		 862 aa  1249    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  43.74 
 
 		 878 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  43.32 
 
 		 886 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  43.32 
 
 		 886 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  42.28 
 
 		 906 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  43.93 
 
 		 883 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  40.75 
 
 		 895 aa  594  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  42.44 
 
 		 914 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  37.38 
 
 		 876 aa  589  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  41.52 
 
 		 894 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  37.17 
 
 		 894 aa  582  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  38.67 
 
 		 882 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  44.33 
 
 		 879 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.71 
 
 		 910 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  39.12 
 
 		 893 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  37.76 
 
 		 887 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  39.64 
 
 		 902 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.91 
 
 		 908 aa  556  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.07 
 
 		 918 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38.28 
 
 		 885 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  39.34 
 
 		 877 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  39.22 
 
 		 877 aa  537  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.63 
 
 		 901 aa  531  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.24 
 
 		 881 aa  526  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.59 
 
 		 879 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  38.35 
 
 		 939 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  39.29 
 
 		 900 aa  518  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  42.74 
 
 		 746 aa  516  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  44.44 
 
 		 755 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  43.77 
 
 		 722 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  42.61 
 
 		 743 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  35.08 
 
 		 874 aa  505  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  42.37 
 
 		 741 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.83 
 
 		 874 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  41.64 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  40.5 
 
 		 727 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  41.48 
 
 		 723 aa  477  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  41.67 
 
 		 744 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  38.53 
 
 		 730 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  38.53 
 
 		 723 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  38.45 
 
 		 727 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  38.39 
 
 		 730 aa  442  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  41.77 
 
 		 748 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.4 
 
 		 622 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  31.67 
 
 		 636 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  32.55 
 
 		 637 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.45 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  36.32 
 
 		 664 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  36.91 
 
 		 538 aa  206  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.99 
 
 		 646 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.89 
 
 		 778 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.33 
 
 		 778 aa  194  6e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  28.84 
 
 		 560 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  31.83 
 
 		 584 aa  191  5e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.12 
 
 		 573 aa  191  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  39.39 
 
 		 576 aa  185  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.5 
 
 		 755 aa  170  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.98 
 
 		 755 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.43 
 
 		 757 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32.82 
 
 		 328 aa  168  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 1103 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.58 
 
 		 647 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  37.74 
 
 		 581 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  37.42 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  37.42 
 
 		 581 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  37.42 
 
 		 581 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  35.6 
 
 		 593 aa  154  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  34.43 
 
 		 597 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31 
 
 		 754 aa  153  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  35.54 
 
 		 579 aa  151  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  30.83 
 
 		 441 aa  150  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  34.1 
 
 		 725 aa  146  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  35.83 
 
 		 562 aa  145  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.17 
 
 		 585 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 		 593 aa  144  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.39 
 
 		 1086 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  34.81 
 
 		 569 aa  140  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  34.49 
 
 		 579 aa  140  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 594 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  33.65 
 
 		 588 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 594 aa  140  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>