240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1379 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  49.21 
 
 
755 aa  717    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  62.93 
 
 
750 aa  989    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  47.16 
 
 
757 aa  686    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  48.94 
 
 
755 aa  715    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  100 
 
 
754 aa  1568    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  39.34 
 
 
778 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  38.95 
 
 
778 aa  548  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  47.4 
 
 
328 aa  293  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2049  glutamate-cysteine ligase  35.71 
 
 
484 aa  243  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1975  Glutathione synthase  35.97 
 
 
462 aa  237  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0781696 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0061  glutamate-cysteine ligase  32.04 
 
 
446 aa  232  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.398399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1395  glutamate-cysteine ligase  30.07 
 
 
509 aa  198  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3369  glutamate--cysteine ligase  30.06 
 
 
532 aa  182  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00208999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0987  glutamate--cysteine ligase  32.41 
 
 
520 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1002  glutamate--cysteine ligase  31.5 
 
 
518 aa  181  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3234  glutamate--cysteine ligase  30.06 
 
 
532 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0891  glutamate--cysteine ligase  30.06 
 
 
532 aa  180  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000207295  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1120  glutamate--cysteine ligase  29.93 
 
 
517 aa  177  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00403409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2654  glutamate-cysteine ligase  30.2 
 
 
536 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.440832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0847  glutamate--cysteine ligase  30.64 
 
 
520 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000051454  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3207  glutamate--cysteine ligase  29.4 
 
 
517 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0090  glutamate--cysteine ligase  31.28 
 
 
524 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1557  glutamate--cysteine ligase  34.64 
 
 
474 aa  172  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3188  glutamate--cysteine ligase  29.58 
 
 
518 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00136573  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3373  glutamate--cysteine ligase  28.45 
 
 
526 aa  171  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02543  glutamate-cysteine ligase  29.36 
 
 
518 aa  170  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0996  glutamate/cysteine ligase  29.36 
 
 
518 aa  170  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172637  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3934  glutamate--cysteine ligase  29.36 
 
 
518 aa  170  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.161519  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1019  glutamate--cysteine ligase  29.36 
 
 
518 aa  170  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.145998  normal  0.0132259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02508  hypothetical protein  29.36 
 
 
518 aa  170  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2824  glutamate--cysteine ligase  29.36 
 
 
518 aa  170  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00050885  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2810  glutamate--cysteine ligase  29.36 
 
 
518 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000302956  hitchhiker  0.00165416 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3168  glutamate--cysteine ligase  28.54 
 
 
514 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2971  glutamate--cysteine ligase  28.38 
 
 
518 aa  169  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000810543  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3003  glutamate--cysteine ligase  29.71 
 
 
518 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179247  hitchhiker  0.000116011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2968  glutamate--cysteine ligase  29.71 
 
 
518 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209272  hitchhiker  0.00113196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3020  glutamate--cysteine ligase  29.71 
 
 
518 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.427194  hitchhiker  0.0000869019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2937  glutamate--cysteine ligase  29.71 
 
 
518 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3127  glutamate--cysteine ligase  29.71 
 
 
518 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  0.0373745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  32.65 
 
 
881 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0201  glutamate--cysteine ligase  29.96 
 
 
523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3571  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  31.81 
 
 
518 aa  164  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0087  glutamate--cysteine ligase  29.57 
 
 
548 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000417414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05020  glutamate--cysteine ligase  29.96 
 
 
530 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402642  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3202  glutamate--cysteine ligase  29.15 
 
 
537 aa  161  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.676712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1098  glutamate--cysteine ligase  30.57 
 
 
549 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0043  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  29.43 
 
 
527 aa  160  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2536  glutamate--cysteine ligase  29.44 
 
 
533 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3149  glutamate--cysteine ligase  29.44 
 
 
533 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0324  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
548 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000109041  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1031  glutamate--cysteine ligase  30.35 
 
 
549 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1132  glutamate--cysteine ligase  30.35 
 
 
549 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  32.82 
 
 
896 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2980  glutamate--cysteine ligase  29.56 
 
 
549 aa  160  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3062  glutamate--cysteine ligase  29.56 
 
 
549 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0117  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
533 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000417338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6505  glutamate--cysteine ligase  29.02 
 
 
537 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104225  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1036  glutamate--cysteine ligase  29.96 
 
 
549 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2325  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
537 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3260  glutamate--cysteine ligase  30.35 
 
 
549 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2302  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
537 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2834  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
537 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000012706  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0118  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
537 aa  159  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000414773  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2251  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
537 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0100341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0134  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 
537 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3087  glutamate--cysteine ligase  28.94 
 
 
537 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00169886  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0035  glutamate-cysteine ligase  29.2 
 
 
527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3169  glutamate--cysteine ligase  29.23 
 
 
537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00288227  hitchhiker  0.00000108947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0356  glutamate--cysteine ligase  30.11 
 
 
526 aa  157  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1058  glutamate--cysteine ligase  27.69 
 
 
526 aa  157  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002530  glutamate--cysteine ligase  26.82 
 
 
522 aa  157  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1219  glutamate--cysteine ligase  29.44 
 
 
524 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  32 
 
 
895 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3160  glutamate--cysteine ligase  29.65 
 
 
549 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.768452  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3559  glutamate--cysteine ligase  29.47 
 
 
564 aa  155  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3143  glutamate--cysteine ligase  29.44 
 
 
537 aa  155  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000827615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  35.85 
 
 
858 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0046  glutamate--cysteine ligase  28.21 
 
 
526 aa  154  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1329  glutamate--cysteine ligase  27.38 
 
 
544 aa  154  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.423999  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  32.02 
 
 
893 aa  153  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3583  glutamate-cysteine ligase  28.07 
 
 
530 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  31 
 
 
855 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4969  glutamate--cysteine ligase  30.04 
 
 
525 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03486  glutamate--cysteine ligase  27.56 
 
 
522 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  31.9 
 
 
862 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  30.46 
 
 
861 aa  152  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  34.78 
 
 
876 aa  152  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  31.2 
 
 
856 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0258  glutamate--cysteine ligase  29.11 
 
 
530 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358158  normal  0.0162786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0268  glutamate--cysteine ligase  29.39 
 
 
530 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1072  glutamate--cysteine ligase  28.66 
 
 
539 aa  150  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5948  glutamate--cysteine ligase  29.14 
 
 
527 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906336  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1208  glutamate--cysteine ligase  28.75 
 
 
522 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0243  glutamate--cysteine ligase  29.03 
 
 
525 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1227  glutamate--cysteine ligase  28.78 
 
 
523 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0110  glutamate/cysteine ligase  30.13 
 
 
532 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  31.8 
 
 
908 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4078  glutamate--cysteine ligase  28.76 
 
 
529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  33.08 
 
 
918 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3430  glutamate--cysteine ligase  31.29 
 
 
530 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>