More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0982 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
1103 aa  680    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  100 
 
 
1086 aa  2209    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  28 
 
 
646 aa  208  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  28.9 
 
 
664 aa  197  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  27.75 
 
 
894 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  36.15 
 
 
910 aa  172  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  28.47 
 
 
882 aa  167  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  28.29 
 
 
896 aa  164  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  29.37 
 
 
894 aa  162  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  34.39 
 
 
887 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  29.55 
 
 
902 aa  158  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  31.35 
 
 
876 aa  157  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  33.11 
 
 
914 aa  157  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  27.98 
 
 
751 aa  157  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  28.01 
 
 
877 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  28.42 
 
 
856 aa  156  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  27.8 
 
 
877 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  27.51 
 
 
879 aa  156  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  29.36 
 
 
879 aa  154  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.44 
 
 
514 aa  153  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.89 
 
 
637 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  26.36 
 
 
881 aa  152  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  28.95 
 
 
918 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  24.95 
 
 
885 aa  151  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.29 
 
 
647 aa  151  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  27.84 
 
 
856 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  33.22 
 
 
893 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  27.56 
 
 
886 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  26.19 
 
 
549 aa  147  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.32 
 
 
512 aa  147  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  27.56 
 
 
886 aa  147  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.78 
 
 
622 aa  146  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  30 
 
 
875 aa  146  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  30.2 
 
 
723 aa  145  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  30.09 
 
 
895 aa  145  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  27.08 
 
 
855 aa  145  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  26.67 
 
 
857 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  32.66 
 
 
636 aa  144  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  32.09 
 
 
906 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  23.4 
 
 
507 aa  144  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  27.83 
 
 
861 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  24.38 
 
 
503 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  25.61 
 
 
856 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  26.39 
 
 
855 aa  143  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  26.88 
 
 
908 aa  143  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  27.83 
 
 
861 aa  142  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  29.66 
 
 
730 aa  142  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  27.13 
 
 
858 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  25.6 
 
 
499 aa  141  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  26.76 
 
 
871 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  28.06 
 
 
856 aa  140  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  30.29 
 
 
727 aa  140  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2354  putative acetyl-CoA synthetase  24.9 
 
 
511 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.804997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 
500 aa  139  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  27.84 
 
 
855 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  27.84 
 
 
855 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  29.14 
 
 
939 aa  138  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  28.74 
 
 
861 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  25.77 
 
 
755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.17 
 
 
510 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  23.65 
 
 
577 aa  136  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  23.65 
 
 
577 aa  136  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  23.65 
 
 
574 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  27.53 
 
 
883 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  26.9 
 
 
862 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  27.27 
 
 
744 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 
498 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  22.46 
 
 
519 aa  134  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  26.44 
 
 
743 aa  134  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  24.14 
 
 
560 aa  134  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.98 
 
 
510 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  23.54 
 
 
499 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.98 
 
 
510 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.93 
 
 
510 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.45 
 
 
500 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  24.25 
 
 
500 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.98 
 
 
510 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  26 
 
 
890 aa  133  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.55 
 
 
491 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.12 
 
 
510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  24.33 
 
 
556 aa  133  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.12 
 
 
510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  27.25 
 
 
746 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  29.97 
 
 
723 aa  133  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  24.69 
 
 
748 aa  132  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  25.94 
 
 
730 aa  132  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 
520 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  27.55 
 
 
901 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2517  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.94 
 
 
513 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94794  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  22.47 
 
 
510 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  24.25 
 
 
500 aa  132  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  22.57 
 
 
500 aa  131  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.73 
 
 
510 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  24.28 
 
 
520 aa  131  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.23 
 
 
510 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  25.33 
 
 
485 aa  130  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  23.15 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  23.15 
 
 
500 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.85 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 
514 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>