More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1416 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  71.89 
 
 
755 aa  1023    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  60.22 
 
 
723 aa  867    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  58.7 
 
 
886 aa  823    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  71.66 
 
 
748 aa  1016    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  53.57 
 
 
751 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  59.02 
 
 
878 aa  838    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  52.99 
 
 
730 aa  751    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  61.17 
 
 
723 aa  877    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  82.38 
 
 
744 aa  1199    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  60.35 
 
 
727 aa  865    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  55.12 
 
 
746 aa  754    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  66.49 
 
 
741 aa  978    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  60.16 
 
 
722 aa  855    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  49.86 
 
 
871 aa  683    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  68.49 
 
 
727 aa  995    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  100 
 
 
743 aa  1499    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  58.7 
 
 
886 aa  823    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  59.51 
 
 
883 aa  815    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  60.92 
 
 
730 aa  875    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  41.26 
 
 
896 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  41.41 
 
 
856 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.65 
 
 
894 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  43.18 
 
 
855 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  40.9 
 
 
875 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.2 
 
 
895 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  40.71 
 
 
861 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  40.71 
 
 
861 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  39.89 
 
 
879 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  42.41 
 
 
865 aa  460  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  41.17 
 
 
856 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  40.47 
 
 
856 aa  458  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.38 
 
 
879 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  42.65 
 
 
862 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  41.15 
 
 
856 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  35.2 
 
 
882 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  39.48 
 
 
858 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  36.46 
 
 
877 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 
885 aa  443  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  38.72 
 
 
857 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  36.33 
 
 
877 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  39.92 
 
 
890 aa  445  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  34.97 
 
 
876 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  40.26 
 
 
914 aa  442  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.08 
 
 
894 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  39.25 
 
 
908 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  36.99 
 
 
906 aa  436  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  39.25 
 
 
861 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
855 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  42.28 
 
 
872 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  36.23 
 
 
902 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  37.83 
 
 
910 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  40.49 
 
 
855 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  40.49 
 
 
855 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  37.85 
 
 
918 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  37.26 
 
 
901 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  34.92 
 
 
893 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.41 
 
 
900 aa  415  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  38.48 
 
 
881 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  32.83 
 
 
887 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  35.21 
 
 
939 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  29.31 
 
 
874 aa  336  1e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  29.04 
 
 
874 aa  328  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  32.73 
 
 
622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.96 
 
 
637 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.14 
 
 
636 aa  174  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  29.22 
 
 
646 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.43 
 
 
664 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.48 
 
 
778 aa  151  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
1103 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  25.61 
 
 
573 aa  150  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.83 
 
 
778 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.38 
 
 
755 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.38 
 
 
755 aa  146  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.36 
 
 
647 aa  144  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  32.92 
 
 
328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.16 
 
 
757 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.44 
 
 
1086 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.99 
 
 
593 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  31.59 
 
 
579 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  31.4 
 
 
581 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.94 
 
 
569 aa  126  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  37.37 
 
 
594 aa  124  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.6 
 
 
754 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  32.14 
 
 
585 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
588 aa  123  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
588 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 
593 aa  120  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  29.21 
 
 
572 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  32.04 
 
 
571 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
581 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  23.56 
 
 
441 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
582 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  26.81 
 
 
340 aa  115  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  26.81 
 
 
340 aa  114  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  28.94 
 
 
582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  30.72 
 
 
579 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  29.94 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  29.65 
 
 
581 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.37 
 
 
750 aa  112  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
562 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>