More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1350 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  41.45 
 
 		 881 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  53.23 
 
 		 893 aa  920    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  42.37 
 
 		 900 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  41.54 
 
 		 877 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  41.66 
 
 		 877 aa  652    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  41.51 
 
 		 879 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  41.99 
 
 		 918 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  54.2 
 
 		 882 aa  979    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  41.82 
 
 		 901 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  40.52 
 
 		 894 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  39.8 
 
 		 910 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  52.02 
 
 		 876 aa  896    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  42.26 
 
 		 894 aa  702    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  44.1 
 
 		 874 aa  717    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  43.92 
 
 		 874 aa  715    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.98 
 
 		 902 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 887 aa  1813    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  39.75 
 
 		 914 aa  649    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  42.58 
 
 		 885 aa  706    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  39 
 
 		 908 aa  632  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 		 856 aa  595  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  39.48 
 
 		 879 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  36.76 
 
 		 939 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  39.38 
 
 		 858 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  38.45 
 
 		 906 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  37.66 
 
 		 875 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  38.14 
 
 		 895 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  37.94 
 
 		 857 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  39 
 
 		 865 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  39.7 
 
 		 861 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  38.75 
 
 		 890 aa  568  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  38.8 
 
 		 856 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  39.47 
 
 		 861 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  38.94 
 
 		 856 aa  568  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  37.76 
 
 		 855 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  38.48 
 
 		 856 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  37.91 
 
 		 861 aa  551  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  38.07 
 
 		 855 aa  552  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  38.24 
 
 		 855 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  38.24 
 
 		 855 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  38.56 
 
 		 862 aa  542  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  36.71 
 
 		 896 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  36.02 
 
 		 871 aa  525  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  37.57 
 
 		 872 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  34.81 
 
 		 878 aa  505  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  34.73 
 
 		 886 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  34.73 
 
 		 886 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  34.15 
 
 		 883 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  35.03 
 
 		 730 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  33.84 
 
 		 751 aa  416  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  35.06 
 
 		 755 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  34.48 
 
 		 746 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  33.11 
 
 		 741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  33.75 
 
 		 727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  33.38 
 
 		 743 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  34.08 
 
 		 723 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  34.59 
 
 		 748 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  33.19 
 
 		 730 aa  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  33.56 
 
 		 722 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  34.45 
 
 		 723 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  33.52 
 
 		 744 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  34.39 
 
 		 727 aa  376  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  34.12 
 
 		 622 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  33.59 
 
 		 560 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  27.82 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  34.59 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  32.86 
 
 		 636 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  32.35 
 
 		 584 aa  204  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  36.15 
 
 		 576 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  37.26 
 
 		 328 aa  194  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  32.73 
 
 		 538 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  36.22 
 
 		 778 aa  187  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.49 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.32 
 
 		 573 aa  179  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  29.67 
 
 		 664 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  28.57 
 
 		 646 aa  177  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  30.25 
 
 		 427 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.78 
 
 		 647 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  30.46 
 
 		 1086 aa  168  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.35 
 
 		 755 aa  164  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.1 
 
 		 755 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.71 
 
 		 757 aa  157  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  36.4 
 
 		 594 aa  157  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.91 
 
 		 725 aa  153  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.77 
 
 		 584 aa  147  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 1103 aa  145  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  29.91 
 
 		 571 aa  144  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.67 
 
 		 750 aa  144  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  28.25 
 
 		 441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.19 
 
 		 584 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.29 
 
 		 754 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  32.49 
 
 		 579 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  34.44 
 
 		 585 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  33.22 
 
 		 593 aa  138  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  30.1 
 
 		 612 aa  137  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2607  hypothetical protein  32.17 
 
 		 340 aa  136  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.89 
 
 		 569 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2734  hypothetical protein  31.85 
 
 		 340 aa  135  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.52 
 
 		 578 aa  134  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  34.44 
 
 		 585 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>