More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4040 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  73.66 
 
 
861 aa  1223    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  46.74 
 
 
871 aa  713    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  74.53 
 
 
890 aa  1239    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  67.79 
 
 
857 aa  1162    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  69.85 
 
 
856 aa  1188    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  100 
 
 
865 aa  1727    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  81.47 
 
 
855 aa  1319    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  66.16 
 
 
856 aa  1113    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  70.31 
 
 
855 aa  1140    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  64.39 
 
 
856 aa  1079    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  69.42 
 
 
858 aa  1184    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  76.34 
 
 
862 aa  1231    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  76.22 
 
 
855 aa  1280    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  75.92 
 
 
872 aa  1205    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  69.84 
 
 
856 aa  1164    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  75.7 
 
 
861 aa  1281    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  75.7 
 
 
861 aa  1281    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  73.75 
 
 
875 aa  1264    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  54.01 
 
 
896 aa  888    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  70.31 
 
 
855 aa  1140    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  42.91 
 
 
878 aa  622  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 
886 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  40.87 
 
 
882 aa  612  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  43.15 
 
 
886 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  42.91 
 
 
883 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  39.05 
 
 
876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  41.58 
 
 
906 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  37.47 
 
 
894 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  42.56 
 
 
914 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  40.88 
 
 
894 aa  583  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  39 
 
 
887 aa  585  1.0000000000000001e-165  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  39.12 
 
 
902 aa  580  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  39.16 
 
 
895 aa  574  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.09 
 
 
910 aa  572  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  41.09 
 
 
908 aa  561  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.27 
 
 
918 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  38.02 
 
 
893 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  43.19 
 
 
879 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  38.47 
 
 
877 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  38.58 
 
 
877 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  38 
 
 
885 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  38.59 
 
 
879 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  40.34 
 
 
881 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  38.67 
 
 
901 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  43.58 
 
 
746 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  40.84 
 
 
939 aa  521  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.88 
 
 
900 aa  520  1e-146  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.88 
 
 
874 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.92 
 
 
874 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  44.64 
 
 
755 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  42.94 
 
 
722 aa  489  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  40.92 
 
 
741 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  40.14 
 
 
730 aa  482  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  40.41 
 
 
751 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  41.48 
 
 
743 aa  479  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  40.3 
 
 
727 aa  472  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  41.75 
 
 
723 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  40.29 
 
 
730 aa  459  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  40.42 
 
 
723 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  40.52 
 
 
744 aa  452  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  40.18 
 
 
727 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  40.69 
 
 
748 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  31.96 
 
 
622 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  36.7 
 
 
538 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  32.54 
 
 
646 aa  217  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  31.68 
 
 
636 aa  203  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  22.57 
 
 
741 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  30.23 
 
 
560 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.38 
 
 
637 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  38.83 
 
 
576 aa  195  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.75 
 
 
584 aa  194  8e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  32.73 
 
 
664 aa  194  8e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.28 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.33 
 
 
778 aa  183  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.33 
 
 
778 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.69 
 
 
757 aa  178  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.86 
 
 
328 aa  173  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.13 
 
 
647 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.52 
 
 
755 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 
1103 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.21 
 
 
755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  36.92 
 
 
725 aa  153  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  35.07 
 
 
754 aa  152  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  35.91 
 
 
593 aa  145  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  36.36 
 
 
581 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.86 
 
 
578 aa  143  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  35.69 
 
 
581 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  34.48 
 
 
333 aa  142  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  34.08 
 
 
579 aa  142  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  30.05 
 
 
427 aa  141  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  26.67 
 
 
441 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  35.4 
 
 
581 aa  141  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  35.4 
 
 
581 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
593 aa  140  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  35.81 
 
 
585 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  26.45 
 
 
1086 aa  137  8e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  33.44 
 
 
588 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
594 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
594 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
594 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>