More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0515 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  45.92 
 
 
918 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  41.4 
 
 
908 aa  644    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  47.93 
 
 
877 aa  785    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  53.56 
 
 
895 aa  933    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  46.42 
 
 
901 aa  764    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  42.5 
 
 
910 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  48.06 
 
 
879 aa  797    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  45.77 
 
 
894 aa  728    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.89 
 
 
914 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  100 
 
 
906 aa  1858    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  43.35 
 
 
879 aa  654    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  46.77 
 
 
900 aa  763    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  41.8 
 
 
876 aa  664    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  46.17 
 
 
902 aa  761    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  47.49 
 
 
877 aa  785    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  42.4 
 
 
881 aa  633  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  39.98 
 
 
939 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  42.28 
 
 
855 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  40.21 
 
 
882 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  40.6 
 
 
885 aa  622  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  41.26 
 
 
858 aa  618  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
893 aa  615  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  41.58 
 
 
865 aa  614  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  41.51 
 
 
875 aa  610  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  41.14 
 
 
857 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  40.65 
 
 
856 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  42.22 
 
 
861 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  42.22 
 
 
861 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.98 
 
 
894 aa  605  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  39.21 
 
 
856 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  38.45 
 
 
887 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  40.79 
 
 
890 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  40.89 
 
 
861 aa  592  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  39.54 
 
 
856 aa  588  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  35.41 
 
 
874 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  42.21 
 
 
871 aa  583  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  38.7 
 
 
896 aa  580  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  40.02 
 
 
855 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.95 
 
 
874 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  40.02 
 
 
855 aa  580  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  38.62 
 
 
856 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  38.95 
 
 
878 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  40.65 
 
 
855 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  40.86 
 
 
862 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  37.61 
 
 
886 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  37.61 
 
 
886 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  39.56 
 
 
872 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  37.44 
 
 
883 aa  522  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  37.4 
 
 
751 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  38.82 
 
 
755 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  38.3 
 
 
746 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  36.99 
 
 
743 aa  449  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  38.15 
 
 
727 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  36.91 
 
 
748 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  34.6 
 
 
741 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 
730 aa  425  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  35.87 
 
 
723 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  37.33 
 
 
722 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  35.52 
 
 
727 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  35.59 
 
 
744 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  35.88 
 
 
723 aa  416  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  35.21 
 
 
730 aa  413  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  32.49 
 
 
637 aa  237  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  34.77 
 
 
560 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  28.66 
 
 
622 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.64 
 
 
636 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  35.42 
 
 
584 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.65 
 
 
664 aa  208  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  35.88 
 
 
538 aa  205  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.86 
 
 
646 aa  194  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  40.87 
 
 
576 aa  191  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  28.72 
 
 
573 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  22.7 
 
 
741 aa  177  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1989  Mur ligase middle domain-containing protein  28.39 
 
 
427 aa  163  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  31.12 
 
 
595 aa  157  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.21 
 
 
755 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.98 
 
 
757 aa  152  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.6 
 
 
755 aa  151  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13520  UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase  31.34 
 
 
725 aa  150  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0923131  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
593 aa  149  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  31.97 
 
 
328 aa  147  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  32.09 
 
 
1086 aa  144  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  31.23 
 
 
597 aa  144  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.4 
 
 
584 aa  143  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  25.74 
 
 
647 aa  144  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
1103 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  27.62 
 
 
441 aa  141  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  32.92 
 
 
569 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  31.87 
 
 
571 aa  139  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.06 
 
 
778 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.25 
 
 
578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.43 
 
 
778 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  30.28 
 
 
579 aa  134  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.82 
 
 
584 aa  134  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  31.56 
 
 
582 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  31.56 
 
 
582 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  32.08 
 
 
585 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  31.49 
 
 
593 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  35 
 
 
333 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
562 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>