236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1825 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  100 
 
 		 778 aa  1553    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  97.43 
 
 		 778 aa  1519    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  43.35 
 
 		 755 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  43.35 
 
 		 755 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  40.88 
 
 		 757 aa  592  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  39.34 
 
 		 754 aa  549  1e-154  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  39.82 
 
 		 750 aa  536  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  60 
 
 		 328 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1975  Glutathione synthase  44.37 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0781696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1557  glutamate--cysteine ligase  34.86 
 
 		 474 aa  260  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0696  glutamate/cysteine ligase  30.23 
 
 		 524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05020  glutamate--cysteine ligase  29.7 
 
 		 530 aa  224  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402642  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1339  glutamate/cysteine ligase  29.25 
 
 		 510 aa  220  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.881569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2521  glutamate-cysteine ligase  29.54 
 
 		 510 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000545569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0110  glutamate/cysteine ligase  29.83 
 
 		 532 aa  217  7e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6505  glutamate--cysteine ligase  28.63 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104225  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2262  glutamate-cysteine ligase  29.07 
 
 		 518 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0149794  unclonable  0.0000000142325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1308  glutamate--cysteine ligase  32.49 
 
 		 527 aa  216  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0750  glutamate--cysteine ligase  31.1 
 
 		 530 aa  215  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3202  glutamate--cysteine ligase  28.63 
 
 		 537 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.676712  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3087  glutamate--cysteine ligase  28.63 
 
 		 537 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00169886  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5948  glutamate--cysteine ligase  29.96 
 
 		 527 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3169  glutamate--cysteine ligase  29.07 
 
 		 537 aa  213  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00288227  hitchhiker  0.00000108947 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2536  glutamate--cysteine ligase  29.07 
 
 		 533 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3149  glutamate--cysteine ligase  29.07 
 
 		 533 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0243  glutamate--cysteine ligase  28.82 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3583  glutamate-cysteine ligase  29.4 
 
 		 530 aa  210  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1058  glutamate--cysteine ligase  30.53 
 
 		 526 aa  211  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0268  glutamate--cysteine ligase  29.03 
 
 		 530 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.237882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0087  glutamate--cysteine ligase  29.2 
 
 		 548 aa  210  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000417414  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0258  glutamate--cysteine ligase  28.82 
 
 		 530 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358158  normal  0.0162786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3399  glutamate-cysteine ligase  31.23 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3143  glutamate--cysteine ligase  29.2 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000827615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0118  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 537 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000414773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3637  glutamate/cysteine ligase  31.03 
 
 		 518 aa  208  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0117  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 533 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000417338  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2325  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 537 aa  208  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82079  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0324  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 548 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000109041  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2251  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 537 aa  207  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0100341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2302  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 537 aa  208  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0134  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 537 aa  208  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2834  glutamate--cysteine ligase  28.74 
 
 		 537 aa  208  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000012706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1329  glutamate--cysteine ligase  31.48 
 
 		 544 aa  207  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.423999  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1366  glutamate--cysteine ligase  28.54 
 
 		 533 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0257  glutamate--cysteine ligase  30.7 
 
 		 532 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68730  glutamate--cysteine ligase  29.74 
 
 		 527 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3953  glutamate--cysteine ligase  28.12 
 
 		 538 aa  205  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0255  glutamate--cysteine ligase  29.76 
 
 		 535 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3207  glutamate--cysteine ligase  28.6 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2471  glutamate--cysteine ligase  29.98 
 
 		 509 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1120  glutamate--cysteine ligase  29.03 
 
 		 517 aa  206  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00403409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3086  glutamate--cysteine ligase  27.25 
 
 		 547 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0401294  hitchhiker  0.00000000000210379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0325  glutamate--cysteine ligase  29.79 
 
 		 529 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3430  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 		 530 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3369  glutamate--cysteine ligase  28.51 
 
 		 532 aa  204  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00208999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1925  glutamate--cysteine ligase  29.4 
 
 		 519 aa  204  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0891  glutamate--cysteine ligase  28.57 
 
 		 532 aa  203  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000207295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0847  glutamate--cysteine ligase  30.92 
 
 		 520 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000051454  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3234  glutamate--cysteine ligase  28.57 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314176  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1606  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  30.18 
 
 		 519 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.526422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2324  glutamate/cysteine ligase  28.99 
 
 		 528 aa  202  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.995496  normal  0.291443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1227  glutamate--cysteine ligase  29.45 
 
 		 523 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1208  glutamate--cysteine ligase  30.33 
 
 		 522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3571  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  26.97 
 
 		 518 aa  201  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2980  glutamate--cysteine ligase  29.17 
 
 		 549 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002530  glutamate--cysteine ligase  30.52 
 
 		 522 aa  201  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4484  glutamate--cysteine ligase  31.11 
 
 		 538 aa  201  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0203665  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0201  glutamate--cysteine ligase  28.72 
 
 		 523 aa  200  7e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3062  glutamate--cysteine ligase  29.17 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1002  glutamate--cysteine ligase  29.31 
 
 		 518 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  36.59 
 
 		 876 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4969  glutamate--cysteine ligase  28.23 
 
 		 525 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0551  glutamate--cysteine ligase  28.64 
 
 		 507 aa  198  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.152428 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3160  glutamate--cysteine ligase  28.97 
 
 		 549 aa  197  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.768452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2467  glutamate--cysteine ligase  27.67 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 		 855 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03486  glutamate--cysteine ligase  30.75 
 
 		 522 aa  196  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02763  glutamate cysteine ligase  30.37 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.969679  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 		 856 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0090  glutamate--cysteine ligase  29.73 
 
 		 524 aa  195  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1036  glutamate--cysteine ligase  30.02 
 
 		 549 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0035  glutamate-cysteine ligase  29.91 
 
 		 527 aa  195  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  35.06 
 
 		 858 aa  195  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  34.7 
 
 		 896 aa  195  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  37.46 
 
 		 881 aa  194  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2654  glutamate-cysteine ligase  28.34 
 
 		 536 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.440832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  32.92 
 
 		 875 aa  194  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0043  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  29.45 
 
 		 527 aa  194  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0987  glutamate--cysteine ligase  29.49 
 
 		 520 aa  194  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3934  glutamate--cysteine ligase  29.12 
 
 		 518 aa  194  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.161519  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  35.87 
 
 		 857 aa  194  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3168  glutamate--cysteine ligase  27.02 
 
 		 514 aa  193  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2810  glutamate--cysteine ligase  28.69 
 
 		 518 aa  193  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000302956  hitchhiker  0.00165416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02543  glutamate-cysteine ligase  28.69 
 
 		 518 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0996  glutamate/cysteine ligase  28.69 
 
 		 518 aa  193  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2824  glutamate--cysteine ligase  28.69 
 
 		 518 aa  193  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00050885  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1019  glutamate--cysteine ligase  28.69 
 
 		 518 aa  193  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.145998  normal  0.0132259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02508  hypothetical protein  28.69 
 
 		 518 aa  193  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  33.64 
 
 		 856 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3260  glutamate--cysteine ligase  29.05 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.116271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>