More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0703 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  90.87 
 
 		 855 aa  1493    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  69.01 
 
 		 875 aa  1177    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  68.97 
 
 		 861 aa  1161    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  54.05 
 
 		 896 aa  889    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  90.87 
 
 		 855 aa  1493    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  71.55 
 
 		 855 aa  1157    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  68.15 
 
 		 861 aa  1139    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  70.26 
 
 		 855 aa  1181    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  71.81 
 
 		 857 aa  1238    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  90.16 
 
 		 856 aa  1554    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  68.97 
 
 		 861 aa  1162    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  69.44 
 
 		 856 aa  1184    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  70.11 
 
 		 858 aa  1213    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  70.1 
 
 		 872 aa  1118    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  69.84 
 
 		 865 aa  1171    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 856 aa  1729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  71.86 
 
 		 862 aa  1153    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  47.42 
 
 		 871 aa  717    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  67.21 
 
 		 890 aa  1118    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  65.34 
 
 		 856 aa  1094    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  42.62 
 
 		 878 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  42.18 
 
 		 886 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  42.18 
 
 		 886 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  42.36 
 
 		 883 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  42.03 
 
 		 894 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  38.82 
 
 		 894 aa  589  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  40.16 
 
 		 902 aa  588  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  38.33 
 
 		 876 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  41.97 
 
 		 910 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  38.48 
 
 		 887 aa  578  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  38.62 
 
 		 906 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  39.33 
 
 		 882 aa  568  1e-160  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  39.05 
 
 		 895 aa  565  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  40.25 
 
 		 918 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  41.6 
 
 		 914 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  39.91 
 
 		 877 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  40.02 
 
 		 877 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  42.4 
 
 		 879 aa  555  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  39.4 
 
 		 885 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.63 
 
 		 879 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  39.61 
 
 		 901 aa  541  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  37.28 
 
 		 893 aa  537  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.93 
 
 		 881 aa  538  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  40.85 
 
 		 908 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  38.97 
 
 		 900 aa  527  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  42.42 
 
 		 746 aa  514  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  38.57 
 
 		 939 aa  512  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  41.78 
 
 		 751 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  34.3 
 
 		 874 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  34.18 
 
 		 874 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  41.94 
 
 		 755 aa  481  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  41.08 
 
 		 722 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  41.15 
 
 		 743 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  40.6 
 
 		 730 aa  475  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  39.73 
 
 		 741 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  38.55 
 
 		 727 aa  465  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  40.71 
 
 		 744 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  39.23 
 
 		 723 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  40.75 
 
 		 748 aa  429  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  37.64 
 
 		 730 aa  426  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  38.37 
 
 		 723 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  38.14 
 
 		 727 aa  416  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  28.82 
 
 		 622 aa  227  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  31.56 
 
 		 646 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  32.41 
 
 		 636 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  32.59 
 
 		 637 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.99 
 
 		 664 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1872  mur ligase family protein  33.85 
 
 		 584 aa  209  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.960352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.11 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.64 
 
 		 778 aa  204  8e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.64 
 
 		 778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3565  Mur ligase middle domain-containing protein  35.64 
 
 		 538 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.96 
 
 		 647 aa  197  8.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2756  Mur ligase family protein  29.72 
 
 		 560 aa  194  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.86 
 
 		 573 aa  189  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.18 
 
 		 757 aa  184  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4828  Mur ligase middle domain protein  37.63 
 
 		 576 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.13 
 
 		 328 aa  181  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  32.4 
 
 		 755 aa  168  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.78 
 
 		 755 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  38.54 
 
 		 581 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  39.19 
 
 		 585 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  38.05 
 
 		 579 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 1103 aa  160  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.78 
 
 		 754 aa  159  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  39.86 
 
 		 585 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  28.06 
 
 		 1086 aa  157  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  38.05 
 
 		 593 aa  156  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  37.5 
 
 		 581 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  37.16 
 
 		 581 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  37.16 
 
 		 581 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  34.87 
 
 		 597 aa  152  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  35.6 
 
 		 562 aa  151  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.92 
 
 		 750 aa  150  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  30.31 
 
 		 441 aa  150  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.81 
 
 		 569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  34.03 
 
 		 612 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  38.4 
 
 		 579 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  35.47 
 
 		 571 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  35.14 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>