245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2956 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  77.97 
 
 		 581 aa  870    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  77.14 
 
 		 582 aa  912    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  77.66 
 
 		 582 aa  919    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  78.75 
 
 		 581 aa  917    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  77.97 
 
 		 581 aa  840    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  77.97 
 
 		 581 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  78.01 
 
 		 581 aa  871    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  78.63 
 
 		 585 aa  907    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  78.81 
 
 		 585 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  77.95 
 
 		 579 aa  904    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  100 
 
 		 579 aa  1180    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  55.19 
 
 		 593 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  56.8 
 
 		 571 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  51.38 
 
 		 597 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  56.24 
 
 		 569 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  54.38 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  51.01 
 
 		 578 aa  551  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  52.36 
 
 		 562 aa  542  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  53.04 
 
 		 588 aa  542  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  55.39 
 
 		 572 aa  535  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  50.36 
 
 		 612 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  52.13 
 
 		 593 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  50.83 
 
 		 584 aa  510  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  52.13 
 
 		 588 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  48.53 
 
 		 584 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 594 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0916  glutathione synthase  50.74 
 
 		 616 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  49.64 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  38.36 
 
 		 881 aa  177  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  37.19 
 
 		 896 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  36.48 
 
 		 861 aa  163  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  39.06 
 
 		 855 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  39.06 
 
 		 855 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  35.83 
 
 		 875 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  36.76 
 
 		 861 aa  160  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  36.76 
 
 		 861 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  34.85 
 
 		 914 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  32.51 
 
 		 895 aa  154  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  35.54 
 
 		 855 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  35.14 
 
 		 894 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  33.43 
 
 		 857 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  32.39 
 
 		 858 aa  150  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  32.92 
 
 		 856 aa  149  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  37.71 
 
 		 856 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  32.4 
 
 		 882 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  36.7 
 
 		 856 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  34.24 
 
 		 908 aa  144  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  36.15 
 
 		 856 aa  144  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  34.57 
 
 		 879 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  33.75 
 
 		 910 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  29.72 
 
 		 893 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  32.49 
 
 		 887 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  30.75 
 
 		 918 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  30.63 
 
 		 876 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  37.04 
 
 		 855 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  32.23 
 
 		 939 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  32.51 
 
 		 901 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  31.89 
 
 		 879 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  33.96 
 
 		 862 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  33.12 
 
 		 885 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  32.61 
 
 		 900 aa  134  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  31.58 
 
 		 906 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  35.62 
 
 		 865 aa  134  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  30.89 
 
 		 902 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  34.43 
 
 		 890 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  29.35 
 
 		 894 aa  130  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  33.54 
 
 		 878 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  30.03 
 
 		 877 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  30.03 
 
 		 877 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  34.34 
 
 		 872 aa  127  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  29.52 
 
 		 730 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  31.47 
 
 		 746 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.25 
 
 		 778 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  32.1 
 
 		 871 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  28.71 
 
 		 328 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.56 
 
 		 778 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  30.96 
 
 		 755 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  32.94 
 
 		 722 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  31.99 
 
 		 748 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  31.45 
 
 		 886 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  31.45 
 
 		 886 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  30.46 
 
 		 741 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  30.57 
 
 		 646 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  30.72 
 
 		 743 aa  114  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  27 
 
 		 874 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  27.3 
 
 		 874 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  33.12 
 
 		 883 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  31.78 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  31.74 
 
 		 751 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  31.61 
 
 		 727 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  29.63 
 
 		 723 aa  107  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  29.7 
 
 		 622 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 1103 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.14 
 
 		 757 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  28.22 
 
 		 723 aa  105  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  28.22 
 
 		 727 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  25.22 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  28.05 
 
 		 1086 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>