More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1006 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  59.24 
 
 		 886 aa  826    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  100 
 
 		 744 aa  1499    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  60.14 
 
 		 730 aa  870    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  71.76 
 
 		 748 aa  1021    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  53.89 
 
 		 751 aa  769    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  58.88 
 
 		 878 aa  824    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  59.24 
 
 		 886 aa  826    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  55.07 
 
 		 746 aa  752    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  69.38 
 
 		 755 aa  986    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  58.47 
 
 		 722 aa  830    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  82.38 
 
 		 743 aa  1236    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  60.14 
 
 		 723 aa  869    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  60.05 
 
 		 883 aa  823    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  59.86 
 
 		 727 aa  853    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  68.48 
 
 		 727 aa  977    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  50.41 
 
 		 871 aa  692    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  59.73 
 
 		 723 aa  854    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  53.08 
 
 		 730 aa  755    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  67.16 
 
 		 741 aa  972    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  40.95 
 
 		 856 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  40.53 
 
 		 896 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  37.57 
 
 		 895 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  41.75 
 
 		 856 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  43.24 
 
 		 855 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  40.13 
 
 		 875 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  39.86 
 
 		 861 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  39.73 
 
 		 861 aa  465  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  42.5 
 
 		 865 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.11 
 
 		 894 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  41.31 
 
 		 879 aa  460  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  40.71 
 
 		 856 aa  462  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  40.14 
 
 		 890 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  39.87 
 
 		 861 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  39.56 
 
 		 856 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  39.49 
 
 		 879 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  38.75 
 
 		 877 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  38.18 
 
 		 857 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  38.9 
 
 		 877 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  41.5 
 
 		 862 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  38.32 
 
 		 858 aa  445  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  39.47 
 
 		 894 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  39.8 
 
 		 908 aa  440  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  40.71 
 
 		 855 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  37.19 
 
 		 910 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  40.71 
 
 		 855 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  41.12 
 
 		 855 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  38.76 
 
 		 918 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  40.26 
 
 		 914 aa  435  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  40.85 
 
 		 872 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  37.13 
 
 		 902 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  36.45 
 
 		 885 aa  429  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  37.68 
 
 		 901 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  34.81 
 
 		 876 aa  426  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  34.41 
 
 		 882 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  35.59 
 
 		 906 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  37.24 
 
 		 900 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  33.92 
 
 		 893 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  39.08 
 
 		 881 aa  397  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  33.52 
 
 		 887 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  34.33 
 
 		 939 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  30.3 
 
 		 874 aa  343  9e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  30.07 
 
 		 874 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  30.11 
 
 		 636 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  33.07 
 
 		 622 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  31.15 
 
 		 637 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  34.82 
 
 		 664 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  27.47 
 
 		 646 aa  174  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  31.09 
 
 		 647 aa  158  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 1103 aa  157  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.98 
 
 		 778 aa  151  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.67 
 
 		 778 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  27.27 
 
 		 1086 aa  144  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.23 
 
 		 573 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 		 593 aa  140  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.65 
 
 		 757 aa  137  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.32 
 
 		 594 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.54 
 
 		 755 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.29 
 
 		 755 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  25.6 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  32.62 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  33.85 
 
 		 569 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 588 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  29.19 
 
 		 578 aa  120  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  32.22 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  32.5 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 593 aa  119  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  32.04 
 
 		 571 aa  114  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.23 
 
 		 588 aa  114  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  32.11 
 
 		 585 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  32.4 
 
 		 562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  22.36 
 
 		 741 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  31.78 
 
 		 579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 		 594 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 		 594 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 		 594 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  29.19 
 
 		 597 aa  112  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  30.94 
 
 		 581 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.59 
 
 		 754 aa  111  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  30.63 
 
 		 581 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>