144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0916 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  62.65 
 
 
584 aa  677    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  62.65 
 
 
584 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  59.11 
 
 
593 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0916  glutathione synthase  100 
 
 
616 aa  1222    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  90.42 
 
 
612 aa  1090    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  59.72 
 
 
588 aa  628  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 
594 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 
594 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 
594 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  62.61 
 
 
609 aa  613  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  54.98 
 
 
593 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  53.12 
 
 
597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  53.52 
 
 
569 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  54.87 
 
 
571 aa  551  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  52.54 
 
 
595 aa  548  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  51.72 
 
 
578 aa  545  1e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  53.6 
 
 
562 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  51.37 
 
 
588 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  51.08 
 
 
585 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  51.62 
 
 
585 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  52.01 
 
 
572 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  49.91 
 
 
582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  49.91 
 
 
582 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  50.36 
 
 
579 aa  510  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  50.18 
 
 
579 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  51.2 
 
 
581 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  50.56 
 
 
581 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  46.76 
 
 
581 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  50.56 
 
 
581 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  50 
 
 
581 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  35.62 
 
 
881 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  31.23 
 
 
876 aa  153  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  35.4 
 
 
896 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  32.09 
 
 
895 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  30.25 
 
 
918 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  33.96 
 
 
857 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  30.43 
 
 
893 aa  145  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  34.67 
 
 
875 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  31.46 
 
 
882 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  36.31 
 
 
861 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  36.31 
 
 
861 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  34.33 
 
 
856 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  34.72 
 
 
856 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  33.45 
 
 
894 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  35.6 
 
 
861 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  29.67 
 
 
887 aa  135  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  32.42 
 
 
914 aa  135  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  34.02 
 
 
856 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  33.93 
 
 
855 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  33.93 
 
 
855 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.75 
 
 
778 aa  133  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  31.06 
 
 
856 aa  133  9e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  30.56 
 
 
894 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.44 
 
 
778 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  29.55 
 
 
901 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  30.3 
 
 
874 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  30.64 
 
 
910 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  34.06 
 
 
862 aa  130  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  30.68 
 
 
874 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  30.3 
 
 
902 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  31.09 
 
 
328 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  29.2 
 
 
900 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  31.75 
 
 
879 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  34.58 
 
 
855 aa  128  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  32.97 
 
 
858 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  31.65 
 
 
879 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  29.31 
 
 
939 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  30.66 
 
 
877 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  30.45 
 
 
906 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  30.32 
 
 
885 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  30.22 
 
 
877 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  29.79 
 
 
908 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  32.71 
 
 
890 aa  121  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  33.33 
 
 
865 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.62 
 
 
755 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.19 
 
 
754 aa  118  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  24.86 
 
 
757 aa  117  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  28.98 
 
 
755 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  30.34 
 
 
871 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  33.78 
 
 
855 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  29.5 
 
 
730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  32.23 
 
 
872 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  29.47 
 
 
878 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  27.93 
 
 
748 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  29.27 
 
 
886 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  29.27 
 
 
886 aa  107  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  30.65 
 
 
883 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  27.51 
 
 
573 aa  104  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  24.25 
 
 
750 aa  102  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  25.26 
 
 
333 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  29.55 
 
 
790 aa  102  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  27.72 
 
 
646 aa  101  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  22.13 
 
 
441 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  29.5 
 
 
743 aa  100  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  28 
 
 
730 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  28.87 
 
 
741 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  28.57 
 
 
727 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  28.36 
 
 
723 aa  95.9  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  25 
 
 
723 aa  95.1  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  28.09 
 
 
744 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>