111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3634 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 482 aa  972    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  32.32 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  33.49 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  32.79 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  31.58 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  33.05 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  30.17 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  30.13 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  33.49 
 
 		 515 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  31.65 
 
 		 493 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  29.08 
 
 		 475 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  23.59 
 
 		 467 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  25.28 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  26.19 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  23.74 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  28.99 
 
 		 508 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.96 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  25.19 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  23.26 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 482 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  23.26 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  28.33 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  24.47 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.25 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.57 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  23.89 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  24.92 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  29.34 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  29.34 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  29.34 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  24.92 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  24.92 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  31.78 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  24.58 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  29.34 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  29.34 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  29.34 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  29.34 
 
 		 490 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  20.73 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1199  carbohydrate kinase FGGY  26.22 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.535076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  28.97 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  26.53 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  28.28 
 
 		 493 aa  53.9  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  32.43 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  28.1 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  28.1 
 
 		 493 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2411  carbohydrate kinase FGGY  25.1 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0077  xylulokinase  28.76 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  24.28 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  28.67 
 
 		 481 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  29.49 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  27.69 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  24.28 
 
 		 494 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  29.81 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  24.94 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  26.43 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  21.25 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  21.72 
 
 		 511 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  21.72 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  25.64 
 
 		 549 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  18.52 
 
 		 505 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  27.93 
 
 		 510 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  24.9 
 
 		 484 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  25.98 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1868  xylulokinase  26.64 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.933233  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  22.54 
 
 		 512 aa  47  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  25.62 
 
 		 538 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0224  xylulokinase  25.99 
 
 		 483 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  23.46 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  23.46 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  23.46 
 
 		 511 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4156  xylulokinase  29.49 
 
 		 485 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  27.76 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  27.87 
 
 		 485 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1385  carbohydrate kinase FGGY  28.69 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.2287  normal  0.0601829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  20.69 
 
 		 488 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  21.72 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  27.27 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  24.22 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4544  xylulokinase  26.43 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  28.09 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  26.45 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  26.84 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  26.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  26.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4438  xylulokinase  27.9 
 
 		 485 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  26.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  26.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3807  xylulokinase  28.32 
 
 		 481 aa  44.3  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.702656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  25.11 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  26.84 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  26.06 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  26.61 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  26.61 
 
 		 484 aa  43.9  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>