More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3607 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  100 
 
 		 331 aa  676    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  80.36 
 
 		 331 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  78.79 
 
 		 331 aa  546  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  65.76 
 
 		 331 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  62.82 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  53.46 
 
 		 327 aa  358  9e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  46.54 
 
 		 330 aa  275  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  45.28 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  42.77 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  45.21 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  41.77 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  44.19 
 
 		 329 aa  249  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  45.42 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  40.74 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  43.38 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  43.08 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  43.05 
 
 		 329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  43.69 
 
 		 329 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  43.04 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  42.33 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 319 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  38.8 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  38.8 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  40.2 
 
 		 306 aa  229  5e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  42.44 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  38.68 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  42.44 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  40.51 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.44 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  42.44 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.12 
 
 		 326 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  41.8 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.8 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.03 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  37.05 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  38.32 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  38.57 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  36.99 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  36.42 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  35.02 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  36.91 
 
 		 317 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  35.85 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  34.58 
 
 		 314 aa  202  9e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  37.07 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  38.63 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  38.11 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  34.52 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  39.16 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  36.05 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  35.53 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  37.06 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  35.28 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  36.83 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  38.17 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  33.96 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  37.77 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  37.79 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.55 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  36.31 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  36.98 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  36.1 
 
 		 317 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  36.89 
 
 		 449 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 333 aa  185  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.9 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  36.51 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  36.99 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  34.6 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.9 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.9 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.9 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  35.35 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  37.9 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.9 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  36.1 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  35.78 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  32.14 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  34.08 
 
 		 328 aa  183  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  32.7 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  37.34 
 
 		 332 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  37.04 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  32.32 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.58 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  37.74 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  35.26 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  35.26 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.62 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.69 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.82 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>