More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2050 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  100 
 
 
318 aa  638    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  70.61 
 
 
324 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  63.52 
 
 
319 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  63.21 
 
 
319 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  62.97 
 
 
316 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  62.66 
 
 
319 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  63.78 
 
 
312 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  68.05 
 
 
319 aa  414  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  62.74 
 
 
319 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
341 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
349 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  47.32 
 
 
347 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
327 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  45.87 
 
 
329 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  45.54 
 
 
329 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
327 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  44.7 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
331 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
331 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  36.94 
 
 
330 aa  228  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
327 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
332 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
331 aa  223  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
331 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  41.04 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  37.88 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  38.69 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  38.49 
 
 
311 aa  218  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.12 
 
 
332 aa  208  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
319 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
330 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
317 aa  206  5e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  38.8 
 
 
332 aa  205  8e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
343 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  37.74 
 
 
319 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
328 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  36.48 
 
 
317 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  38.05 
 
 
328 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  35.16 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  35.42 
 
 
330 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
327 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  34.59 
 
 
327 aa  192  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  35.83 
 
 
318 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  34.07 
 
 
311 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  37.33 
 
 
324 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  31.52 
 
 
333 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
328 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.94 
 
 
312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  35.62 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  36.48 
 
 
326 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 
311 aa  188  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.82 
 
 
308 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  32.59 
 
 
317 aa  188  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.54 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.86 
 
 
311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  36.7 
 
 
309 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 
311 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  38.7 
 
 
317 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  36.86 
 
 
308 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
331 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
319 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  34.69 
 
 
330 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
312 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
312 aa  186  4e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
319 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.23 
 
 
311 aa  186  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
332 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  34.48 
 
 
331 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  36.22 
 
 
328 aa  185  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
332 aa  185  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  29.94 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  38.62 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  36.68 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  34.6 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  30.82 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  36.7 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  34.59 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
314 aa  183  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  37.3 
 
 
320 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
331 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
343 aa  182  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  35.94 
 
 
331 aa  182  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  34.07 
 
 
331 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  34.48 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  34.8 
 
 
339 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  37.09 
 
 
328 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  32 
 
 
326 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  34.74 
 
 
315 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  36.81 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.65 
 
 
311 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  35.24 
 
 
328 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>