More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0370 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  100 
 
 		 328 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  64.1 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  62.46 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  62.75 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  58.28 
 
 		 331 aa  391  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  53.05 
 
 		 327 aa  338  9e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  44.86 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  44.24 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  39.57 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  40 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  42.33 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  42.18 
 
 		 342 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  42.46 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.67 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  37 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  42.76 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.03 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  41.03 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  38.63 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.03 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  41.03 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.03 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 319 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.71 
 
 		 326 aa  216  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  40.62 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  42.76 
 
 		 329 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  40 
 
 		 332 aa  212  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  37.19 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  37.19 
 
 		 319 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.89 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  41.55 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  36.88 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  35.87 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  39.3 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  37.22 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  40.4 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  36.34 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  33.75 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  36.16 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  35.49 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.38 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  35.49 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  37.03 
 
 		 327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  36.36 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  38.11 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.12 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  34.97 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  35.02 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.12 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.12 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.12 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.12 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  35.82 
 
 		 319 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  38.08 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  33.65 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  37.16 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  34.49 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  33.98 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  37.13 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  36.51 
 
 		 324 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.81 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  37.9 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.02 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.65 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  35.85 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  32.82 
 
 		 327 aa  176  4e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 325 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  35.83 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.65 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  35.24 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  36 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  34.69 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  36.7 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.39 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  35.22 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  35.87 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  32.81 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  37.14 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  34.57 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  33.86 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  33.66 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.22 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  34.89 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  34.16 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  36.71 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  34.59 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  37.34 
 
 		 328 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  36.14 
 
 		 330 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>