More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2056 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  100 
 
 		 327 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  86.77 
 
 		 326 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  86.77 
 
 		 326 aa  598  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  86.77 
 
 		 326 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  86.46 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  86.46 
 
 		 326 aa  596  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  86.46 
 
 		 326 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  86.11 
 
 		 326 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  69.02 
 
 		 326 aa  498  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  43.77 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  40.26 
 
 		 331 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  38.91 
 
 		 331 aa  209  8e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  36.04 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  34.81 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  36.34 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  36.16 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.06 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  32.2 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  37.09 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  36.36 
 
 		 329 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.54 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  35.31 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.45 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  34.15 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  35.02 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  35.35 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  34.18 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  34.94 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  34.19 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.19 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  35 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  32.39 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  32.47 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  33.75 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  34.94 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  38.06 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  35.74 
 
 		 317 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.09 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  34.05 
 
 		 315 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 332 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  33.64 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  34.87 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  34.81 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  35.31 
 
 		 342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  31.78 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  33 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  32.27 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  32.1 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  32.1 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  33.53 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  33.96 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  33.13 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  33.93 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  33.74 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  34.37 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  33.75 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  34.48 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  35.38 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  34.46 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  34.46 
 
 		 349 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  33.1 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.75 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  36.72 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  33.86 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  34.98 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  33.23 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  33.99 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  32.94 
 
 		 358 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  33.23 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  34.23 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  32.17 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  32.8 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  35.37 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  32.56 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  33.65 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>