More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1923 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  100 
 
 
312 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  80.13 
 
 
319 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  72.58 
 
 
319 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  73.4 
 
 
316 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  72.58 
 
 
319 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  69.55 
 
 
319 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  65.16 
 
 
324 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  57.56 
 
 
319 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  64.14 
 
 
318 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  52.35 
 
 
341 aa  325  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  47.42 
 
 
347 aa  298  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  48.43 
 
 
349 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
327 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
314 aa  222  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  41.58 
 
 
329 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  40.8 
 
 
329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  39.61 
 
 
329 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  38.44 
 
 
319 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
342 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
327 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  34.71 
 
 
331 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  38.54 
 
 
327 aa  205  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  34.97 
 
 
330 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  37.81 
 
 
319 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  35.02 
 
 
331 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  35 
 
 
331 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  34.38 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  35.74 
 
 
311 aa  199  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  37.63 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
319 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
319 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
319 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  34.29 
 
 
327 aa  191  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  36.31 
 
 
328 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  34.33 
 
 
306 aa  189  5.999999999999999e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  35.37 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.77 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  34.1 
 
 
311 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  36.08 
 
 
331 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  35.26 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  34.09 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  35.99 
 
 
340 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  33.98 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  33.86 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.29 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  31.74 
 
 
328 aa  178  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.77 
 
 
311 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.77 
 
 
311 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  35.29 
 
 
320 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.77 
 
 
311 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.77 
 
 
311 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
335 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.79 
 
 
311 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
311 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  35.58 
 
 
330 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
328 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  35.9 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
332 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  35.51 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  32.13 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  33.01 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  34.71 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.81 
 
 
332 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  32.91 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
338 aa  172  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
360 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  34.69 
 
 
318 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  36.49 
 
 
328 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  32.69 
 
 
330 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
317 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
330 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  32.58 
 
 
317 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
314 aa  170  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  35.31 
 
 
343 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
328 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  34.94 
 
 
327 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  32.5 
 
 
326 aa  169  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  32.48 
 
 
328 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  35.25 
 
 
332 aa  169  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  33.77 
 
 
325 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
317 aa  169  8e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
331 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
331 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
328 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  35.4 
 
 
317 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
345 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  33.01 
 
 
330 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  35.83 
 
 
343 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  33.55 
 
 
328 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
328 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.67 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2012  aryl-alcohol dehydrogenase  30.79 
 
 
325 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  34.82 
 
 
329 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>