More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6755 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  100 
 
 
333 aa  679    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  70.64 
 
 
328 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  56.88 
 
 
330 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  57.27 
 
 
330 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  46.56 
 
 
331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  45 
 
 
331 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  45.4 
 
 
327 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  44.62 
 
 
331 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  45.06 
 
 
331 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  40.46 
 
 
327 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
319 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  40.33 
 
 
329 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
319 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
328 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
319 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
319 aa  208  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
319 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  35.62 
 
 
311 aa  207  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
342 aa  205  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  37.65 
 
 
332 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.36 
 
 
332 aa  202  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
319 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  38.03 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  38.69 
 
 
331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
306 aa  195  1e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  37.25 
 
 
349 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  34.05 
 
 
319 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  36.12 
 
 
349 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
317 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0842  aryl-alcohol dehydrogenase  37.38 
 
 
302 aa  189  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  35.71 
 
 
327 aa  189  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  35.78 
 
 
329 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  37.17 
 
 
329 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  36.92 
 
 
323 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  33.53 
 
 
347 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.16 
 
 
327 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  34.55 
 
 
319 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  34.77 
 
 
314 aa  187  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  36.79 
 
 
305 aa  186  5e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  36.02 
 
 
326 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  35.45 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  36.25 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  35.56 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  33.83 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  35.07 
 
 
324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  34.88 
 
 
333 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  33.43 
 
 
344 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.76 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  35.83 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  35.83 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  33.04 
 
 
316 aa  181  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  34.23 
 
 
334 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  34.23 
 
 
347 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.83 
 
 
326 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  36.96 
 
 
329 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  35.51 
 
 
326 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.51 
 
 
326 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  35.45 
 
 
308 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  34.32 
 
 
332 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.51 
 
 
326 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  35.91 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  34.32 
 
 
332 aa  178  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  34.45 
 
 
312 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  34.45 
 
 
312 aa  178  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
336 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.51 
 
 
326 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
319 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  35.17 
 
 
309 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  34.52 
 
 
345 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  35.26 
 
 
340 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  33.73 
 
 
336 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
370 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  33.05 
 
 
351 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
351 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  30.75 
 
 
340 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  36.73 
 
 
314 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  37.28 
 
 
313 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  36.53 
 
 
315 aa  175  8e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  32.76 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  32.76 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  33.14 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  34.93 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  33.04 
 
 
355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  32.94 
 
 
324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  34.15 
 
 
341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  35.36 
 
 
335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  34.35 
 
 
331 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  33.12 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  31.34 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  35.21 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  34.14 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  35.6 
 
 
330 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  32.84 
 
 
342 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  32.84 
 
 
342 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
342 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>