More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2446 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  100 
 
 
342 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  64.83 
 
 
329 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  62.88 
 
 
327 aa  418  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  62.08 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  62.08 
 
 
329 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  59.45 
 
 
329 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.94 
 
 
332 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  59.94 
 
 
332 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  59.09 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  47.55 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
331 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  42.33 
 
 
331 aa  231  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  42.76 
 
 
327 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
331 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  41.55 
 
 
324 aa  219  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  40.34 
 
 
319 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  41.11 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  38.98 
 
 
319 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  37.14 
 
 
312 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  37.75 
 
 
330 aa  206  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
333 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  37.29 
 
 
330 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  37.58 
 
 
316 aa  204  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
318 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  35.2 
 
 
328 aa  202  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  37.33 
 
 
319 aa  199  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
319 aa  199  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  35.95 
 
 
319 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  35.95 
 
 
319 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  42.18 
 
 
328 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
311 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  36.71 
 
 
319 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  37.37 
 
 
319 aa  192  8e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  42.92 
 
 
306 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  40 
 
 
349 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  35.51 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  35.46 
 
 
317 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  36.09 
 
 
317 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.21 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1786  aldo/keto reductase  35.13 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.561691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  35.64 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.21 
 
 
311 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  35.22 
 
 
323 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.21 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.21 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.21 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  34.77 
 
 
317 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  31.21 
 
 
311 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.89 
 
 
311 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
311 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  32.63 
 
 
314 aa  166  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  36.55 
 
 
341 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  37.15 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  36.48 
 
 
327 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.25 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.94 
 
 
311 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.31 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
347 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  34.98 
 
 
326 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.98 
 
 
326 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  34.98 
 
 
326 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.98 
 
 
326 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  36.11 
 
 
312 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  36.11 
 
 
312 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.98 
 
 
326 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  34.65 
 
 
326 aa  159  6e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
318 aa  159  6e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
326 aa  159  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  35.09 
 
 
349 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.44 
 
 
312 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  31.41 
 
 
305 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  38.4 
 
 
328 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  33.44 
 
 
333 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  34.85 
 
 
331 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  34.46 
 
 
339 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  34.95 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
360 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
345 aa  156  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
309 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  35.38 
 
 
345 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  33.85 
 
 
361 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  35.53 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
338 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
323 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  35.4 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1063  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.65668  normal  0.0781696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  34.73 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  34.43 
 
 
331 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
333 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  35.04 
 
 
328 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  35.61 
 
 
324 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  35.52 
 
 
340 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  34.11 
 
 
329 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  32.41 
 
 
322 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  35.78 
 
 
323 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>