More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3114 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3114  aldo-keto reductase  100 
 
 		 329 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0789437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4616  aldo/keto reductase  76.74 
 
 		 331 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2710  aldo/keto reductase  73.64 
 
 		 330 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1260  aldo/keto reductase  72.12 
 
 		 332 aa  492  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2876  aldo/keto reductase  72.42 
 
 		 331 aa  485  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2969  aldo/keto reductase  72.51 
 
 		 331 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.253493  normal  0.0420926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2323  aldo/keto reductase  71.47 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3685  aldo/keto reductase  69.7 
 
 		 331 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.181793 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3317  aldo/keto reductase  72.07 
 
 		 338 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  69.09 
 
 		 332 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2561  aldo/keto reductase  69.18 
 
 		 332 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  66.16 
 
 		 331 aa  451  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4035  aldo/keto reductase  66.97 
 
 		 338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4493  aldo/keto reductase  66.97 
 
 		 338 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3784  aldo/keto reductase  67.08 
 
 		 353 aa  441  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3763  aldo/keto reductase  67.88 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.257211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4605  aldo/keto reductase  67.88 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0673419  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4041  aldo/keto reductase  67.58 
 
 		 337 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.729575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5699  aldo/keto reductase  67.88 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1236  aldo/keto reductase  66.97 
 
 		 338 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.334986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5816  aldo/keto reductase  65.23 
 
 		 332 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4243  aldo/keto reductase  59.94 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.510384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2096  aldo/keto reductase  60.62 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0900272  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  53.68 
 
 		 331 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  52.78 
 
 		 328 aa  334  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  53.29 
 
 		 449 aa  330  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  52.75 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  51.52 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 330 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  50 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  49.39 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  51.72 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 335 aa  315  6e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  50 
 
 		 330 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  50.77 
 
 		 329 aa  311  6.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  47.56 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  51.27 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  49.38 
 
 		 326 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  50.46 
 
 		 332 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  49.09 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  49.09 
 
 		 328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  49.09 
 
 		 326 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  47.27 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0491  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 333 aa  299  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.679501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  47.56 
 
 		 328 aa  298  7e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4141  aldo/keto reductase  46.86 
 
 		 323 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  47.26 
 
 		 328 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  49.68 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  48.63 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  46.18 
 
 		 331 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  48.18 
 
 		 334 aa  292  6e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  48.33 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  48.78 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  51.06 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6178  aldo/keto reductase  44.14 
 
 		 323 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  49.54 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  45.59 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  44.65 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.53 
 
 		 331 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  48.94 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  48.63 
 
 		 329 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  44.98 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 331 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  47.43 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  45.73 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  51.32 
 
 		 328 aa  277  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  47.13 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  48.62 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  46.91 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  44.51 
 
 		 491 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  44.44 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  48.83 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  46.56 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  46.34 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  45.9 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  47.45 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  46.96 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  46.18 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  47.11 
 
 		 329 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  50.32 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  47.28 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  44.38 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  45.06 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  45.26 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  43.83 
 
 		 331 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.62 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  44.94 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  44.55 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  46.65 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  45.2 
 
 		 320 aa  255  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  43.47 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  45.12 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  43.48 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>