More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5029 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  100 
 
 
330 aa  669    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  72.05 
 
 
334 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  68.77 
 
 
328 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  68.71 
 
 
328 aa  448  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
324 aa  443  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  69.07 
 
 
327 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  68.6 
 
 
324 aa  436  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
328 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  67.89 
 
 
449 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  67.28 
 
 
328 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  68.21 
 
 
328 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  68.21 
 
 
328 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  64.35 
 
 
335 aa  427  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  70.73 
 
 
324 aa  427  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  64.02 
 
 
328 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  64.2 
 
 
317 aa  420  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  65.77 
 
 
334 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
329 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  63.25 
 
 
326 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  59.4 
 
 
331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  61.04 
 
 
331 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  63.29 
 
 
340 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  64.07 
 
 
328 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  64.65 
 
 
329 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  63.04 
 
 
325 aa  385  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  59.76 
 
 
331 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  57.62 
 
 
331 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  64.33 
 
 
309 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  62.23 
 
 
491 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  58.04 
 
 
330 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  62.71 
 
 
332 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  58.48 
 
 
330 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  58.63 
 
 
330 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  56.5 
 
 
331 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  57.06 
 
 
330 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  57.98 
 
 
331 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  57.36 
 
 
328 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  56.93 
 
 
330 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  57.53 
 
 
326 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  54.18 
 
 
326 aa  360  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  54.22 
 
 
331 aa  351  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  53.33 
 
 
331 aa  349  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  51.82 
 
 
333 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.19 
 
 
325 aa  346  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  57.76 
 
 
328 aa  346  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  58.66 
 
 
338 aa  345  8e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  55.52 
 
 
329 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
338 aa  344  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  55.32 
 
 
332 aa  342  4e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  55.22 
 
 
329 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  50.62 
 
 
336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  56.65 
 
 
325 aa  338  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  55.95 
 
 
325 aa  338  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  57.83 
 
 
320 aa  335  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
333 aa  335  9e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  51.67 
 
 
331 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  52.73 
 
 
328 aa  333  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  51.68 
 
 
328 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  53.25 
 
 
327 aa  328  7e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  51.99 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  51.68 
 
 
331 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  55.8 
 
 
328 aa  325  5e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
339 aa  325  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
331 aa  324  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  53.41 
 
 
331 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  50 
 
 
331 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  51.67 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
329 aa  320  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  53.54 
 
 
328 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  52.91 
 
 
328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  49.4 
 
 
331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  53.54 
 
 
328 aa  319  5e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  55.21 
 
 
327 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
341 aa  318  9e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  50.46 
 
 
329 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
330 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  52.34 
 
 
320 aa  316  4e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
328 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  51.69 
 
 
329 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  48.94 
 
 
333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
333 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
329 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.53 
 
 
327 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  50.77 
 
 
327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.47 
 
 
329 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3748  aldo/keto reductase  53.73 
 
 
317 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  48.77 
 
 
321 aa  309  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
331 aa  308  6.999999999999999e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  50 
 
 
334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  52.4 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  49.54 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  53.58 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  51.06 
 
 
325 aa  306  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  48 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0404  aldo/keto reductase  51.82 
 
 
328 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284735  normal  0.539127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>