More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4205 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  100 
 
 
338 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  64.24 
 
 
328 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  67.95 
 
 
324 aa  411  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  63.22 
 
 
335 aa  408  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  61.66 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  64.38 
 
 
330 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  61.46 
 
 
317 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  64.47 
 
 
328 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  64.44 
 
 
328 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  61.3 
 
 
330 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  61.56 
 
 
328 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  61.8 
 
 
340 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  66.98 
 
 
329 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  61.83 
 
 
331 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  65.55 
 
 
334 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  60.19 
 
 
330 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  63.32 
 
 
331 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  63.43 
 
 
327 aa  381  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  60.9 
 
 
334 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  64.13 
 
 
328 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  64.72 
 
 
328 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  65.11 
 
 
330 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  61.39 
 
 
326 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  61.56 
 
 
332 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  63.49 
 
 
328 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  65 
 
 
328 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  62.26 
 
 
449 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  63.12 
 
 
324 aa  371  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  62.25 
 
 
329 aa  373  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
331 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.63 
 
 
331 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  58.9 
 
 
331 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  64.33 
 
 
325 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  58.84 
 
 
331 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  58.62 
 
 
331 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  60.12 
 
 
330 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
330 aa  362  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  60.31 
 
 
326 aa  362  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  59.75 
 
 
491 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  65.51 
 
 
324 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  60.68 
 
 
332 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  60.13 
 
 
325 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  55.8 
 
 
331 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  61.87 
 
 
309 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.43 
 
 
325 aa  348  6e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  54.06 
 
 
326 aa  348  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  55.59 
 
 
333 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  52.47 
 
 
328 aa  345  6e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
328 aa  345  8e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  58.18 
 
 
331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  61.41 
 
 
327 aa  342  5.999999999999999e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  59.93 
 
 
325 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  58.23 
 
 
329 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  58.66 
 
 
330 aa  339  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  58.33 
 
 
328 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  57.59 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  54.1 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  52.16 
 
 
331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  51.68 
 
 
338 aa  329  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  56.35 
 
 
328 aa  328  8e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  53.42 
 
 
335 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  52.83 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  58.13 
 
 
320 aa  325  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
326 aa  324  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.66 
 
 
328 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  52.48 
 
 
328 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  52.65 
 
 
334 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  52.37 
 
 
327 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  56.15 
 
 
328 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  56.37 
 
 
320 aa  322  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  53.33 
 
 
327 aa  320  3e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  52.85 
 
 
329 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
339 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  59.55 
 
 
330 aa  318  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  53.8 
 
 
327 aa  318  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  47.58 
 
 
336 aa  318  7e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  53.27 
 
 
334 aa  318  7e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.6 
 
 
327 aa  318  7.999999999999999e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  52.48 
 
 
331 aa  318  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  51.26 
 
 
326 aa  318  9e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  52.22 
 
 
329 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  51.83 
 
 
331 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  53.63 
 
 
329 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.52 
 
 
329 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  52.02 
 
 
334 aa  317  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.52 
 
 
329 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
329 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  52.53 
 
 
329 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.22 
 
 
329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  51.9 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  51.32 
 
 
327 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  54.52 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  53.61 
 
 
331 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  54.3 
 
 
342 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  52.83 
 
 
328 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
320 aa  310  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  50.61 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  52.06 
 
 
327 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
327 aa  309  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>