More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0402 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  100 
 
 		 335 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  80.36 
 
 		 334 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  80.36 
 
 		 334 aa  554  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  77.68 
 
 		 334 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  77.61 
 
 		 334 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  79.4 
 
 		 331 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  71.56 
 
 		 327 aa  501  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  73.05 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  71.04 
 
 		 329 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  75.15 
 
 		 325 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  70.45 
 
 		 329 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  70.15 
 
 		 329 aa  485  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  71.56 
 
 		 330 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  69.25 
 
 		 329 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  71.34 
 
 		 327 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  68.66 
 
 		 327 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  69.76 
 
 		 331 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  69.49 
 
 		 327 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  67.86 
 
 		 331 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  68.96 
 
 		 328 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.46 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  69.46 
 
 		 329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  67.46 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.46 
 
 		 329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  68.66 
 
 		 329 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.66 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.16 
 
 		 329 aa  461  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  69.54 
 
 		 327 aa  461  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  68.36 
 
 		 329 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  67.76 
 
 		 327 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  68.36 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  66.67 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  70.66 
 
 		 330 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  69.63 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  68.92 
 
 		 325 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  66.57 
 
 		 335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  64.48 
 
 		 327 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  66.36 
 
 		 344 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  67.56 
 
 		 329 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  65.56 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  64.58 
 
 		 331 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  62.91 
 
 		 327 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  63.61 
 
 		 326 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  65.66 
 
 		 334 aa  435  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  66.98 
 
 		 342 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  63.83 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  65.24 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  63.19 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  63.28 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  63.11 
 
 		 328 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  61.49 
 
 		 331 aa  411  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6148  aldo/keto reductase  60.3 
 
 		 329 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6149  aldo/keto reductase  57.74 
 
 		 330 aa  394  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  59.76 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0842  aldo/keto reductase  58.9 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.495708  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  58.08 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4369  aldo/keto reductase  69.5 
 
 		 363 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  59.02 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1802  aldo/keto reductase  57.01 
 
 		 372 aa  376  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.246141  normal  0.022853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  56.85 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  59.02 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  53.73 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3215  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2757  aldo/keto reductase  57.4 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0729923 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  54.9 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3904  twin-arginine translocation pathway signal  56.57 
 
 		 385 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.307988  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  56.25 
 
 		 331 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3243  aldo/keto reductase  56.13 
 
 		 388 aa  360  3e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609699  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  54.38 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4221  aldo/keto reductase  55.83 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.886889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2146  aldo/keto reductase  51.9 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32550  Aldo/keto reductase protein  54.65 
 
 		 415 aa  345  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  56.27 
 
 		 330 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  55.66 
 
 		 328 aa  345  8e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  53.12 
 
 		 335 aa  342  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  52.45 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  55.49 
 
 		 327 aa  340  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  53.43 
 
 		 328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  52.44 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  54.04 
 
 		 491 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  53.23 
 
 		 330 aa  336  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 325 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  54.74 
 
 		 324 aa  335  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  52.45 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  51.95 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  51.84 
 
 		 330 aa  332  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  53.07 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  51.99 
 
 		 331 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  53.07 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  51.08 
 
 		 317 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  51.99 
 
 		 360 aa  329  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  52.6 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  50.92 
 
 		 330 aa  328  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  51.98 
 
 		 329 aa  328  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  55.96 
 
 		 330 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  52.45 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  52.76 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1160  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0226313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  50.76 
 
 		 331 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  52.6 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>