More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0614 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  100 
 
 		 330 aa  678    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  93.64 
 
 		 330 aa  642    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  81.52 
 
 		 331 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  79.94 
 
 		 330 aa  562  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  78.18 
 
 		 330 aa  557  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  70.3 
 
 		 331 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  66.47 
 
 		 331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  69.63 
 
 		 340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  69.09 
 
 		 329 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  65.26 
 
 		 331 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  68.79 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  64.85 
 
 		 328 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  67.74 
 
 		 332 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  65.35 
 
 		 328 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  67.19 
 
 		 317 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  64.05 
 
 		 331 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  63.69 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  64.13 
 
 		 328 aa  434  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  65.35 
 
 		 328 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  64.55 
 
 		 324 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  63.41 
 
 		 328 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  64.44 
 
 		 329 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  66.88 
 
 		 329 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  63.94 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  63.14 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  62.92 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  64.57 
 
 		 325 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  62.61 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  63.72 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  61.81 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  63.04 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  61.47 
 
 		 332 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  59.39 
 
 		 327 aa  394  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  59.04 
 
 		 330 aa  391  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  58.86 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  58.73 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  62.19 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  58.84 
 
 		 328 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  57.66 
 
 		 331 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  60.84 
 
 		 334 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  61.66 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  57.98 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  60 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  56.93 
 
 		 333 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  58.13 
 
 		 326 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  59.24 
 
 		 325 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  57.4 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  58.48 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  62.19 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  60.19 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  59.94 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  55.33 
 
 		 338 aa  362  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  54.41 
 
 		 331 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  55.22 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  55.42 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  59.35 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  54.71 
 
 		 328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  57.23 
 
 		 331 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  54.55 
 
 		 325 aa  349  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  52.24 
 
 		 333 aa  348  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  53.99 
 
 		 331 aa  348  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  55.25 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  51.04 
 
 		 336 aa  342  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  52.8 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  53.52 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  55.35 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  51.52 
 
 		 329 aa  334  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  52.5 
 
 		 329 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  51.84 
 
 		 335 aa  332  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  54.4 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.92 
 
 		 329 aa  331  9e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  51.56 
 
 		 329 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  52.78 
 
 		 327 aa  331  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  51.21 
 
 		 329 aa  329  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  50.91 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  51.98 
 
 		 327 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.94 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.94 
 
 		 329 aa  328  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  52.7 
 
 		 320 aa  328  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  50.62 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  52.19 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 327 aa  326  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  50.47 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  51.67 
 
 		 360 aa  325  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  51.56 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  50.47 
 
 		 333 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  52.19 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  50.31 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0451  aldo/keto reductase  51.06 
 
 		 332 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  51.71 
 
 		 327 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  51.23 
 
 		 334 aa  322  5e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  50 
 
 		 334 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  51.54 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2612  aldo/keto reductase  50.15 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  49.06 
 
 		 327 aa  319  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  48.64 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  51.4 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  50.46 
 
 		 327 aa  318  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>