More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0147 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  99.09 
 
 
329 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  100 
 
 
329 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  70.64 
 
 
340 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  69.39 
 
 
330 aa  481  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  68.79 
 
 
330 aa  477  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  70.87 
 
 
332 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  67.78 
 
 
330 aa  465  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  66.26 
 
 
331 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  66.06 
 
 
330 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  61.52 
 
 
331 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  65.65 
 
 
324 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  63.72 
 
 
329 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  58.79 
 
 
331 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  61.7 
 
 
328 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  61.18 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  59.76 
 
 
328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  60.82 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  60.67 
 
 
328 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  61.28 
 
 
328 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  62.2 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  58.91 
 
 
331 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  59.1 
 
 
335 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  61.17 
 
 
309 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  63.46 
 
 
325 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  64.31 
 
 
491 aa  391  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  59.57 
 
 
326 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  61.09 
 
 
328 aa  387  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
331 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
327 aa  388  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  60.98 
 
 
328 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  60.98 
 
 
328 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  65.83 
 
 
324 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  61.39 
 
 
449 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  61.44 
 
 
329 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  56.5 
 
 
331 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  58.49 
 
 
334 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
330 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
331 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  55.72 
 
 
331 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  57.32 
 
 
328 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  56.53 
 
 
326 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  56.75 
 
 
332 aa  361  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  53.92 
 
 
326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  55.22 
 
 
330 aa  354  8.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  55.69 
 
 
334 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  56.33 
 
 
331 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  53.8 
 
 
328 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  54.95 
 
 
333 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  56.83 
 
 
328 aa  348  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1860  aldo/keto reductase  51.99 
 
 
338 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599659  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  54.91 
 
 
330 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
338 aa  347  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
330 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  53.77 
 
 
325 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3931  aldo/keto reductase  58.26 
 
 
330 aa  342  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  54.86 
 
 
328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6700  aldo/keto reductase  49.1 
 
 
339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  56.96 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  50.15 
 
 
331 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  50.76 
 
 
331 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  51.8 
 
 
335 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2325  aldo/keto reductase  49.09 
 
 
336 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
360 aa  333  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  52 
 
 
327 aa  333  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  53.05 
 
 
327 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0669  aldo/keto reductase  54.21 
 
 
333 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.303974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
333 aa  329  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  50.46 
 
 
331 aa  329  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  50.92 
 
 
331 aa  329  5.0000000000000004e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3366  aldo/keto reductase  54.49 
 
 
320 aa  328  6e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  51.08 
 
 
327 aa  327  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  50.91 
 
 
331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  51.21 
 
 
327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  52.75 
 
 
331 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
334 aa  326  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
320 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.66 
 
 
325 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  51.65 
 
 
334 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1352  aldo/keto reductase  51.9 
 
 
320 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.299072  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  49.7 
 
 
329 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  48.64 
 
 
331 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  50 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.45 
 
 
334 aa  320  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4569  aldo/keto reductase  54.36 
 
 
326 aa  319  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.473943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.7 
 
 
329 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  50.3 
 
 
329 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  53.72 
 
 
330 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  51.25 
 
 
329 aa  318  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
331 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  51.88 
 
 
342 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  55.1 
 
 
327 aa  316  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  52.5 
 
 
327 aa  315  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  50.61 
 
 
327 aa  315  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
328 aa  315  7e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.31 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  50.31 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.31 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  51.25 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>