More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1378 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  97.89 
 
 		 331 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  100 
 
 		 331 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  57.32 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  56.88 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  57.62 
 
 		 330 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  58.44 
 
 		 325 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  54.88 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  55.15 
 
 		 329 aa  362  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  55.42 
 
 		 331 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  54.63 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  55.17 
 
 		 328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  54.94 
 
 		 328 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  55.17 
 
 		 328 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  56.11 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  53.96 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  52.76 
 
 		 331 aa  355  5e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  54.22 
 
 		 330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  58.84 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  56.84 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  54.88 
 
 		 327 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  53.99 
 
 		 330 aa  348  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  55.52 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  53.8 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  52.78 
 
 		 326 aa  345  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  55 
 
 		 328 aa  345  4e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  53.75 
 
 		 331 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  54.27 
 
 		 326 aa  344  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  52.41 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  52.98 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  53.15 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  53.15 
 
 		 331 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  54.1 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  56.67 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  51.06 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.32 
 
 		 328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  53.27 
 
 		 326 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  53.48 
 
 		 449 aa  329  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  51.52 
 
 		 340 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  51.83 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3524  aldo/keto reductase  52.54 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.956167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 330 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  49.55 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  52 
 
 		 331 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  52.47 
 
 		 328 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  53.44 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.31 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  50.94 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  50.31 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.31 
 
 		 329 aa  323  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  51.83 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  51.56 
 
 		 329 aa  322  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.23 
 
 		 329 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  49.7 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  51.22 
 
 		 334 aa  320  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 331 aa  319  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  52.66 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  50.3 
 
 		 334 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  51.25 
 
 		 327 aa  317  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  49.39 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  50.91 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2317  aldo/keto reductase  52.02 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  50.62 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.52 
 
 		 334 aa  317  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  51.68 
 
 		 330 aa  316  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  51.06 
 
 		 329 aa  316  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  51.83 
 
 		 328 aa  315  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  46.81 
 
 		 328 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  48.94 
 
 		 328 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  52.24 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  49.39 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  50.78 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1517  aldo/keto reductase  51.51 
 
 		 325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  51.07 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  50.46 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  51.06 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  48.92 
 
 		 331 aa  311  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5308  aldo/keto reductase  56.7 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  53.92 
 
 		 324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  51.39 
 
 		 327 aa  309  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1198  aldo/keto reductase  49.24 
 
 		 327 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2625  aldo/keto reductase  48.17 
 
 		 327 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1904  aldo/keto reductase  50 
 
 		 331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000049592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3518  aldo/keto reductase  52.15 
 
 		 324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  49.1 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  50.3 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  50.82 
 
 		 309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  51.83 
 
 		 338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  47.04 
 
 		 327 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  49.06 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1149  aldo/keto reductase  49.55 
 
 		 360 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.946345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0476  aldo/keto reductase  50.91 
 
 		 344 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.63 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  49.53 
 
 		 327 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  47.83 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  48.19 
 
 		 327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  49.69 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>